Objetivo
Plant development is under the control of abiotic environment. Nitrogen (N) and Carbon (C) signaling are well known to interact together, but also with a set of diverse signaling pathways including light and the plant hormones, auxin or cytokinin. Relationships of C/N “balance” with these “growth factors” are hypothesized to trigger the regulation of broad developmental processes such as root/shoot development or flowering. The overall aim of this proposal is to use a genomics and systems biology approach to design and explore an experimental space to test how the intersection of light, carbon, nitrogen and hormone signaling pathways acts to coordinate responses of gene networks in Arabidopsis. Combinatorial Design will be used to select a set of treatments designed to broadly cover the experimental space of interactions using a minimal number of treatments, as described in Lejay et al 2005, and whole genome responses will be assayed using Affymetrix Gene Chips. The work flow includes: Aim 1. Design and test the entire experimental space of treatments using reporter gene constructs, to aid in selection of an optimal CD set for transcriptome analysis. Aim 2. Integrate & analyze transcriptomic data in the context of Arabidopsis multinetworks to identify regulatory gene networks whose expression is controlled by the interaction of these different signals on gene regulation. This analysis will allow us to identify “hub”-genes involved in coordinating gene network responses to N/C/Light/Hormones signals. Aim 3. Validate the gene regulatory networks by classical reverse-genetics concerning “hub”-gene and to place these molecular actors into previously identified gene networks. This project will mark a significant and useful turn in my scientific experience to genomics, biocomputing and systems biology.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-2007-4-1-IOF
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
75794 PARIS
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.