Objectif
Group II introns are one class of naturally occurring catalytic RNAs, ranging between 600 and thousands of nucleotides in length. These ribozymes catalyze a variety of reactions, among which the self splicing activity is the most prominent one. These large molecular machines are found primarily in organellar genes of plants, fungi and lower eukaryotes, but also in many bacteria. Metal ions are crucial for folding and activity of catalytic RNA molecules, however their structural and mechanicistic roles are poorly understood. Many biochemical studies have been performed in the past, but few structural information is available on group II intron ribozymes. Here we plan to structurally characterize by NMR the kappa-zeta region of domain 1 of the group IIB intron Sc.ai5gamma originating from the cox1 gene in yeast mitochondria, both in the absence and presence of metal ions, in addition to investigate its docking to domain 5. The kappa-zeta region is the most central part of these ribozymes as not only it represents the nucleation core of intron folding but its complex with domain 5 comprises the largest part of the catalytic core. This dual role underlines the significance of any new information on structure, metal ion binding and domain assembly gained of these fascinating molecules, which are considered ancestors not only of the spliceosome but also of large part of the eukaryotic genome. Belonging to action 2 of the FP7 “Work Program-PEOPLE” this project intends to train an experienced researcher in the (for her) novel fascinating field of “Coordination Chemistry of nucleic acids”, a field at the interface between Chemistry and Life Science, two different Marie Curie panels.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule acide nucléique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie mycologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique nucléotide
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome génome eucaryote
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-IEF-2008
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
Zürich
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.