Objectif
The regulation of gene activity via the binding of protein factors to cis acting sequence elements is being studied in great detail. In contrast, little is known about gene regulation in trans, i.e. how sequences on one chromosome control the activity of a gene on another chromosome. There is mounting evidence that such trans regulatory systems are important in higher eukaryotes, including flies, plants and mammals. The aim of this research project is to unravel the molecular mechanism underlying trans gene regulation.
The regulatory system that will be used in this project is the naturally occurring trans inactivation system called paramutation. With paramutation, the trans interaction between high and low expressing epigenetic states of an allele leads to a heritable transcriptional down-regulation of the high expressing epigenetic state. Paramutation has been thoroughly studied in maize, mainly using classical genetics. Importantly, paramutation-like in trans gene regulation phenomena have been observed in other eukaryotes, including humans. The mechanism of paramutation is therefore most likely conserved in evolution, underscoring its importance.
In this project, the genetically well-characterized paramutation of maize b1 alleles is used. The maize system is currently being transferred to Arabidopsis, as the molecular tools available for maize are still limited, while they are ample for Arabidopsis. The transfer to Arabidopsis creates a unique opportunity for the systematic identification and characterization of: (i) the regulatory elements and (ii) the proteins and chromatin structure changes involved.
Results will give insight into the interplay of components and epigenetic changes and thereby the molecular mechanism involved in trans genomic interactions. The basic epigenetic control mechanisms are essentially the same in all higher eukaryotes. Therefore, the knowledge obtained in this project can be extended to other systems.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques zoologie mammalogie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture céréales et oléagineux céréales
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.