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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-05-29

Unraveling the molecular mechanisms underlying genomic in trans interactions

Ziel

The regulation of gene activity via the binding of protein factors to cis acting sequence elements is being studied in great detail. In contrast, little is known about gene regulation in trans, i.e. how sequences on one chromosome control the activity of a gene on another chromosome. There is mounting evidence that such trans regulatory systems are important in higher eukaryotes, including flies, plants and mammals. The aim of this research project is to unravel the molecular mechanism underlying trans gene regulation.

The regulatory system that will be used in this project is the naturally occurring trans inactivation system called paramutation. With paramutation, the trans interaction between high and low expressing epigenetic states of an allele leads to a heritable transcriptional down-regulation of the high expressing epigenetic state. Paramutation has been thoroughly studied in maize, mainly using classical genetics. Importantly, paramutation-like in trans gene regulation phenomena have been observed in other eukaryotes, including humans. The mechanism of paramutation is therefore most likely conserved in evolution, underscoring its importance.

In this project, the genetically well-characterized paramutation of maize b1 alleles is used. The maize system is currently being transferred to Arabidopsis, as the molecular tools available for maize are still limited, while they are ample for Arabidopsis. The transfer to Arabidopsis creates a unique opportunity for the systematic identification and characterization of: (i) the regulatory elements and (ii) the proteins and chromatin structure changes involved.

Results will give insight into the interplay of components and epigenetic changes and thereby the molecular mechanism involved in trans genomic interactions. The basic epigenetic control mechanisms are essentially the same in all higher eukaryotes. Therefore, the knowledge obtained in this project can be extended to other systems.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP6-2002-MOBILITY-5
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Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Koordinator

UNIVERSITY OF AMSTERDAM; SWAMMERDAM INSTITUTE FOR LIFE SCIENCES
EU-Beitrag
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Adresse


Niederlande

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Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

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