Objectif
Allostery is a fundamental concept Nature uses to regulate the affinity of a certain substrate to an active site of a protein by binding a ligand to a distant allosteric site. We will design experimental tools to gain an atomistic understanding of the conformational transitions that give rise to allostery. We will approach the problem from two distinctively different directions. First, we will initiate conformational transitions of proteins that per se are not photoswitchable, by cross-linking two sites of an allosteric protein with a photo-switchable azobenzene-moiety to initiate a conformational transition similar to ligand binding. We will use ultrafast infrared spectroscopy to time-resolve the conformational transition. Second, we will experimentally verify a frequently expressed hypothesis that allosteric and active site communicate by exchange of vibrational energy. To that end, we will design a versatile approach that allows us to locally deposit vibrational energy at essentially any site in a protein (e.g. through pumping of an optical chromophore that undergoes ultrafast internal conversion), and to detect its appearance at any other site by using vibrational transitions as local thermometers. Thereby, we will map out a network of connectivity in a given protein. Both approaches will applied both to one and the same protein family. One concrete example are PDZ domains, which are among the smallest allosteric proteins, and for which the connection between allostery and vibrational energy flow has been made explicit, based on computer simulations. We will eventually test this hypothesis experimentally, and provide the foundation for a description of allostery that is on an equal footing as our current understanding of protein folding.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie spectrométrie d’absorption
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines repliement protéique
- sciences naturelles mathématiques mathématiques appliquées modèle mathématique
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2009-AdG
Voir d’autres projets de cet appel
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
Zürich
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.