Skip to main content
Ir a la página de inicio de la Comisión Europea (se abrirá en una nueva ventana)
español español
CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
CORDIS
Contenido archivado el 2024-05-30

Functional implications of the remarkable conservation of eukaryotic gene architecture

Objetivo

One of the fundamental principles in comparative genomics is that evolutionary conservation implies functional importance. This principle has been used extensively in the life sciences, as a tool to detect biological functionality. In the vast majority of studies, evolutionary conservation has been sought in three biological “entities”: sequence (actual nucleotide or amino-acid sequences, as well as sequence properties like codon usage bias, GC content, and amino-acid bias); structure (like RNA, DNA and protein secondary and tertiary structures); and genome architecture (like synteny, gene order, relative gene orientation). These strategies have worked very well, but evidence is rapidly accumulating that there is a lot of “function without detectable conservation”. Many factors can potentially contribute to such “undetected functionality”, such as functions that do not depend on sequence or structure (for instance, nonsense mediated decay is affected by the mere location of the introns), functions that depend on very short and redundant sequence motifs, co-evolution of factor and target, and migration of functional sequences along the chromosome. We suggest a novel strategy to identify parts of these “undetected functions”. We study how to quantify the conservation in a fourth type of biological “entity”, that we dub gene architecture, and which is derived from the exon-intron structure of the gene. To this end, we are building a eukaryotic gene architecture database, and developing an algorithm to quantitatively evaluate the level of architectonic conservation in the different regions of the gene. Preliminary analysis reveals that conservation of gene architecture is plentiful, and in many cases it can be detected over very long evolutionary times (more than a billion years). This allows us to identify genic elements, mostly introns and splice junctions, which are likely to be of functional importance.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2009-RG
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IRG - International Re-integration Grants (IRG)

Coordinador

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Aportación de la UE
€ 100 000,00
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
Mi folleto 0 0