Objetivo
One of the fundamental principles in comparative genomics is that evolutionary conservation implies functional importance. This principle has been used extensively in the life sciences, as a tool to detect biological functionality. In the vast majority of studies, evolutionary conservation has been sought in three biological “entities”: sequence (actual nucleotide or amino-acid sequences, as well as sequence properties like codon usage bias, GC content, and amino-acid bias); structure (like RNA, DNA and protein secondary and tertiary structures); and genome architecture (like synteny, gene order, relative gene orientation). These strategies have worked very well, but evidence is rapidly accumulating that there is a lot of “function without detectable conservation”. Many factors can potentially contribute to such “undetected functionality”, such as functions that do not depend on sequence or structure (for instance, nonsense mediated decay is affected by the mere location of the introns), functions that depend on very short and redundant sequence motifs, co-evolution of factor and target, and migration of functional sequences along the chromosome. We suggest a novel strategy to identify parts of these “undetected functions”. We study how to quantify the conservation in a fourth type of biological “entity”, that we dub gene architecture, and which is derived from the exon-intron structure of the gene. To this end, we are building a eukaryotic gene architecture database, and developing an algorithm to quantitatively evaluate the level of architectonic conservation in the different regions of the gene. Preliminary analysis reveals that conservation of gene architecture is plentiful, and in many cases it can be detected over very long evolutionary times (more than a billion years). This allows us to identify genic elements, mostly introns and splice junctions, which are likely to be of functional importance.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas biología evolutiva
- ciencias naturales ciencias biológicas genética nucleótido
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-2009-RG
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
91904 JERUSALEM
Israel
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.