Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-05-30

Functional implications of the remarkable conservation of eukaryotic gene architecture

Cel

One of the fundamental principles in comparative genomics is that evolutionary conservation implies functional importance. This principle has been used extensively in the life sciences, as a tool to detect biological functionality. In the vast majority of studies, evolutionary conservation has been sought in three biological “entities”: sequence (actual nucleotide or amino-acid sequences, as well as sequence properties like codon usage bias, GC content, and amino-acid bias); structure (like RNA, DNA and protein secondary and tertiary structures); and genome architecture (like synteny, gene order, relative gene orientation). These strategies have worked very well, but evidence is rapidly accumulating that there is a lot of “function without detectable conservation”. Many factors can potentially contribute to such “undetected functionality”, such as functions that do not depend on sequence or structure (for instance, nonsense mediated decay is affected by the mere location of the introns), functions that depend on very short and redundant sequence motifs, co-evolution of factor and target, and migration of functional sequences along the chromosome. We suggest a novel strategy to identify parts of these “undetected functions”. We study how to quantify the conservation in a fourth type of biological “entity”, that we dub gene architecture, and which is derived from the exon-intron structure of the gene. To this end, we are building a eukaryotic gene architecture database, and developing an algorithm to quantitatively evaluate the level of architectonic conservation in the different regions of the gene. Preliminary analysis reveals that conservation of gene architecture is plentiful, and in many cases it can be detected over very long evolutionary times (more than a billion years). This allows us to identify genic elements, mostly introns and splice junctions, which are likely to be of functional importance.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

FP7-PEOPLE-2009-RG
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

MC-IRG - International Re-integration Grants (IRG)

Koordynator

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Wkład UE
€ 100 000,00
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych
Moja broszura 0 0