Objetivo
The ubiquitin-like proteins SUMO-1 and SUMO-2 are covalently conjugated to a wide range of target proteins where they serve as subunits of complex protein associations (sub-proteomes). These covalent modifications play important roles in cellular processes such as transport, regulation of transcription, signalling, and others. In this proposed project I would like to take advantage of several advanced techniques in molecular cell biology and mass spectrometry.
In the first part of my study I will define the proteins covalently interacting with each of the SUMO paralogues in human cells. To achieve this I will use cell lines with integrated versions of TAP-tagged SUMO-1 and -2, which will allow me to recover them together by affinity with other tightly bound proteins. I will then determine how the abundance of proteins modified by SUMO changes during the course of the cell cycle and in response to stress conditions such as UV, heat and hypoxia.
Quantitative changes in modified proteins will be determined by mass spectrometry using SILAC (Stable Isotope Labelling by Amino acids in Cell culture) technique. These experiments will add significant, new and valuable data concerning SUMO sub-proteomes. Obtained results should allow for creation of complex and hopefully quite clear picture of the relationships among all the analysed proteins.
Summarizing, these data should help our understanding of the many cellular processes not necessarily directly involved in the SUMO sub-proteomes. Lists of SUMO targets will be made available to the scientific community so that groups with an interest in a particular protein can determine the role of SUMO modification in its function.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2004-MOBILITY-5
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
DUNDEE
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.