Objectif
Fungal attack leads to major agricultural crop losses. Use of chemical pesticides to suppress fungal pathogens forms a threat to the environment and human health since some of these pesticides are very persistent and hazardous. Development of environmental friendly disease control strategies, such as biological control based on the use of protective microorganims, is highly required.
The efficacy of biocontrol agents (when applied as an inoculant) is not always consistent. Fundamental knowledge on the inter actions between the fungus and the biocontrol bacterium is required to understand how the biocontrol bacterium functions at the cellular and molecular level, which forms the basis for the biocontrol effect, and which will contribute to an improved inoculum application.
This study will focus on the biocontrol bacterium Bacillus subtilus strain 49b, which is able to protect tomato roots against the attack of the phytopathogenic fungus Fusarium oxysporum. Bacillus bacteria are very suited for inoculum production since they form heat and drought resistant spores. One of the mechanism through which biocontrol of strain 49b might function is its production of anti fungal metabolites (antibiotics), which after a first analysis seem to be of an unknown class.
The project aims at an integrative approach of biochemical, genetic and microscopic analyses to elucidate the biocontrol mechanism(s) of B. subtilus strain b49. State of the art equipment and methods, including confocal laser scanning microscopy and microarray analysis, will be applied to study the interaction of B. subtilus with the target fungus on the tomato root.
The project will result in the identification of the anti fungal metabolites, elucidate their relevance for biocontrol, identify genes that are relevant for biocontrol ability of B. subtilus. Microscopy studies will visualize the interactions between B. subtilus strain 49b (and mutant derivates) and F. oxysporum at the cellular level.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture agronomie protection des végétaux
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie mycologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique antibiotique
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie microscopie confocale
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2004-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
LEIDEN
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.