Objectif
The overall objective of this project is to study the initial phase of gene-transcription – i.e. the transformation of genetic information from DNA to RNA – at the level of individual molecules. State-of-the-art single-molecule fluorescence spectroscopy will be used in combination with a nanoscale “spectroscopic ruler” (a method based on the phenomenon of fluorescence resonance energy transfer, also known as FRET) to capture the transient intermediates and conformational changes of RNA polymerase, the protein machine that orchestrates transcription. This analysis will complement the static snapshots of transcription complexes, which have been obtained using X-ray crystallography. Single-molecule fluorescence methods are well suited for real-time studies of initial transcription, since the available temporal resolution is sufficient for monitoring conformational changes during the addition of a single nucleotide to an RNA chain. The specific aims are to develop novel real-time assays for detecting promoter-DNA opening and promoter-escape in vitro; to use the in vitro assays for studying the effect of specific DNA sequences on promoter-proximal pausing and promoter escape; and to take the first steps towards developing similar single-molecule FRET assays that report on transcription in living bacterial cells. The proposed work will contribute to the understanding of initial transcription, providing insights applicable to the transcription systems of higher organisms such as humans. The proposed toolbox will also find extensive use in the study of other important protein-DNA interactions, both in vitro and in vivo.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement géologie minéralogie cristallographie
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie spectroscopie d’émission
- sciences naturelles sciences biologiques génétique nucléotide
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
OX1 2JD Oxford
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.