Objetivo
Chromatin remodelling complexes (CRCs) of the SWI/SNF family are implicated in numerous regulatory processes of eukaryotic growth, differentiation and development. Multiplicity of genes encoding SNF2-type ATPase and SWI3-type SWI/SNF CRC subunits in Arabidopsis suggests that CRCs carry different combinations of these core components. In yeast two-hybrid screens, we have identified potential auxiliary proteins of Arabidopsis SWI/SNF CRCs and analyse their in vivo interactions with CRC core components by FRET assays. We also accomplished subcellular localization of core CRC subunits by in vivo imaging and established a powerful technology for purification of SWI/SNF CRCs. Our results indicate that the BRM ATPase and ATSWI3C CRC subunits occur in common SWI/SNF complexes and mutations inactivating their genes cause similar phenotypic changes. By Affymetrix transcript profiling and qRT-PCR studies, we have identified a set of genes, which show similarly altered transcription in the atswi3c and atbrm mutants. Furthermore, we characterized genetic interactions of atswi3c mutations with known mutations that affect the functions of key genes controlling physiological and developmental responses to different hormones, and stresses. The proposed reintegration project is based on a focused multidisciplinary approach aiming at precise definition of regulatory functions of SWI/SNF CRCs. Complementary tasks of the experimental work plan aim at the i) identification of primary regulatory targets of SWI/SNF CRCs using transcriptome analysis in combination with inducible knock-down SWI3 subunits; ii) mapping of SWI/SNF-binding domains in target genes using chromatin precipitation; iii) analysis of SWI/SNF CRC-regulated functions in stresses and pathogen signalling pathways. The project is expected to provide a novel insight into regulatory mechanisms by which distinct classes of SWI/SNF CRCs participate in the control of physiological and developmental responses in Arabidopsis.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-2010-RG
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
02 106 Warszawa
Polonia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.