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Contenuto archiviato il 2024-05-28

Characterization of regulatory roles of SWI/SNF-type chromatin remodelling complexes in the control of development and hormonal, biotic and abiotic stress responses in Arabidopsis

Obiettivo

Chromatin remodelling complexes (CRCs) of the SWI/SNF family are implicated in numerous regulatory processes of eukaryotic growth, differentiation and development. Multiplicity of genes encoding SNF2-type ATPase and SWI3-type SWI/SNF CRC subunits in Arabidopsis suggests that CRCs carry different combinations of these core components. In yeast two-hybrid screens, we have identified potential auxiliary proteins of Arabidopsis SWI/SNF CRCs and analyse their in vivo interactions with CRC core components by FRET assays. We also accomplished subcellular localization of core CRC subunits by in vivo imaging and established a powerful technology for purification of SWI/SNF CRCs. Our results indicate that the BRM ATPase and ATSWI3C CRC subunits occur in common SWI/SNF complexes and mutations inactivating their genes cause similar phenotypic changes. By Affymetrix transcript profiling and qRT-PCR studies, we have identified a set of genes, which show similarly altered transcription in the atswi3c and atbrm mutants. Furthermore, we characterized genetic interactions of atswi3c mutations with known mutations that affect the functions of key genes controlling physiological and developmental responses to different hormones, and stresses. The proposed reintegration project is based on a focused multidisciplinary approach aiming at precise definition of regulatory functions of SWI/SNF CRCs. Complementary tasks of the experimental work plan aim at the i) identification of primary regulatory targets of SWI/SNF CRCs using transcriptome analysis in combination with inducible knock-down SWI3 subunits; ii) mapping of SWI/SNF-binding domains in target genes using chromatin precipitation; iii) analysis of SWI/SNF CRC-regulated functions in stresses and pathogen signalling pathways. The project is expected to provide a novel insight into regulatory mechanisms by which distinct classes of SWI/SNF CRCs participate in the control of physiological and developmental responses in Arabidopsis.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2010-RG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-ERG - European Re-integration Grants (ERG)

Coordinatore

INSTYTUT BIOCHEMII I BIOFIZYKI POLSKIEJ AKADEMII NAUK
Contributo UE
€ 45 000,00
Indirizzo
PAWINSKIEGO 5A
02 106 Warszawa
Polonia

Mostra sulla mappa

Regione
Makroregion województwo mazowieckie Warszawski stołeczny Miasto Warszawa
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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