Objectif
The cell can be seen as an intricate network of molecular relationships that determines its potential activities. The study of the composition of such a complex network including not only the description of their elements but also the structure of their relationships, i.e. its topology, was previously used to extract important elements (e.g. hubs proteins) and to find recurrent circuits that characterize regulatory events (e.g. feedforward loops) using mainly protein-protein interactions networks. However, there are no studies that address these questions in a realistic picture of the cell where not only proteins are present but also other elements involved in cell regulation such as DNA, RNA, chemicals or other metabolites. This project proposes building an in silico model of the cell including all these molecules and their interactions by adding several until now unconnected layers of information to address the topological characterization and comparison of several types of protein post-translational modifications, the major mechanism by which protein function is regulated in eukaryotes. This novel network will be annotated by a novel ontology of actions describing molecular relationships and statistically addressed to evaluate the significance of every interaction. This framework will lead to elucidate specific mechanisms of regulation for each type of post-translational modification and be able to make functional prediction the molecules participating by finding similar motifs in uncharacterized events. Moreover, we will study the conservation of the PTMs residues across species to calibrate the potential of the annotation transfer among species that would lead to novel discoveries also in non-model organisms.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2010-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
69117 Heidelberg
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.