Objectif
"There has been an immense investment of time, effort and resources in the development of the technologies that enable DNA sequencing in the past 10 years. Despite the significant advances made, all of the current genomic sequencing technologies suffer from two important shortcomings. Firstly, sample preparation is time-consuming and expensive, and requiring a full day for sample preparation for next-generation sequencing experiments. Secondly, sequence information is delivered in short fragments, which are then assembled into a complete genome. Assembly is time-consuming and often results in a highly fragmented genomic sequence and the loss of important information on large-scale structural variation within the genome.
We recently developed a super-resolution DNA mapping technology, which allows us to uniquely study genetic-scale features in genomic length DNA molecules. Labelling the DNA with fluorescent molecules at specific sequences and using high-resolution fluorescence microscopy enabled us to produce a map of a genomic DNA sequence with unparalleled resolution, the so called FLUOROCODE. In this project we aim to extend our methodology to map longer DNA molecules and to include a multi-colour version of the FLUOROCODE that will allow us to read genomic DNA molecules like a barcode and probe DNA methylation status. The sample preparation, DNA labelling and deposition for imaging will be integrated to allow rapid mapping of DNA molecules. At the same time nanopores will be explored as a route to high-throughput DNA mapping.
FLUOROCODE will develop technology that aims to complement the information derived from current DNA sequencing platforms. The technology developed by FLUOROCODE will enable DNA mapping at unprecedented speed and for a fraction of the cost of a typical DNA sequencing project. We aniticipate that our method will find applications in the rapid identification of pathogens and in producing genomic scaffolds to improve genome sequence assembly."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie microscopie à super-résolution
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2011-ADG_20110209
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
3000 LEUVEN
Belgique
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.