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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-05-27

DNA sequencing using helicase-modified alpha-hemolysin nanopores

Objetivo

"Most of the current, second generation, methods for DNA sequencing are based on alternating cycles of enzyme manipulation and imaging the incorporation of fluorescently labeled nucleotides. These methods, however, hold several disadvantages, mainly the long duration of each sequencing experiment and the requirement for fluorescently labeled nucleotides and primer sequences. Tremendous efforts have been taken in order to develop cheap and ultra-fast sequencing systems. Specifically, the sequencing of single DNA molecules is of great importance, as no pre-amplification step and no labeled nucleotides are required. I intend to use biological nanometer-scale pores (alpha-hemolysin) modified with a DNA manipulating enzyme, a helicase, embedded in a membrane that separates two compartments, each contains an Ag/AgCl electrode, for the sequencing of single DNA molecules. Based on previous results, I expect that the ionic current, associated with DNA translocation through the nanopore, will exhibit a specific pattern for each nucleobase, allowing sequence determination. I intend to construct two different systems, in the first system the helicase will be soluble in the cis compartment, whereas in the second configuration the helicase will be attached to the nanopore via double stranded DNA linkers. The helicase enzyme will unwind double stranded DNA, form a ratchet-like movement of the DNA strand through the pore and control the pace of DNA translocation, leading to efficient sequencing."

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2011-IEF
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinador

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Aportación de la UE
€ 209 033,40
Dirección
WELLINGTON SQUARE UNIVERSITY OFFICES
OX1 2JD Oxford
Reino Unido

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Región
South East (England) Berkshire, Buckinghamshire and Oxfordshire Oxfordshire
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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