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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-27

DNA sequencing using helicase-modified alpha-hemolysin nanopores

Objectif

"Most of the current, second generation, methods for DNA sequencing are based on alternating cycles of enzyme manipulation and imaging the incorporation of fluorescently labeled nucleotides. These methods, however, hold several disadvantages, mainly the long duration of each sequencing experiment and the requirement for fluorescently labeled nucleotides and primer sequences. Tremendous efforts have been taken in order to develop cheap and ultra-fast sequencing systems. Specifically, the sequencing of single DNA molecules is of great importance, as no pre-amplification step and no labeled nucleotides are required. I intend to use biological nanometer-scale pores (alpha-hemolysin) modified with a DNA manipulating enzyme, a helicase, embedded in a membrane that separates two compartments, each contains an Ag/AgCl electrode, for the sequencing of single DNA molecules. Based on previous results, I expect that the ionic current, associated with DNA translocation through the nanopore, will exhibit a specific pattern for each nucleobase, allowing sequence determination. I intend to construct two different systems, in the first system the helicase will be soluble in the cis compartment, whereas in the second configuration the helicase will be attached to the nanopore via double stranded DNA linkers. The helicase enzyme will unwind double stranded DNA, form a ratchet-like movement of the DNA strand through the pore and control the pace of DNA translocation, leading to efficient sequencing."

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2011-IEF
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinateur

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Contribution de l’UE
€ 209 033,40
Adresse
WELLINGTON SQUARE UNIVERSITY OFFICES
OX1 2JD Oxford
Royaume-Uni

Voir sur la carte

Région
South East (England) Berkshire, Buckinghamshire and Oxfordshire Oxfordshire
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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