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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
CORDIS
Contenido archivado el 2024-06-18

Program Development for the Molecular Simulation of Protein-Surface Interactions

Objetivo

"The ability to understand and predict the interactions between proteins and material surfaces represents a critical need for many applications in bionanotechnology and biomedical engineering. Empirical force field molecular simulation methods have the potential to provide this capability, with the European community currently leading the world in this area of research. However, methods have not yet been developed to adequately support these types of simulations. For these simulations, an ideal program will provide the capability of using a Class I protein force field (FF) to model the behavior of the protein in the solution phase, a Class II FF to model the behavior of the solid material phase, and an interfacial FF to control interactions at the liquid-solid interface. In addition, the program must be highly scalable to enable simulations to be efficiently run on today’s large computer clusters via parallel simulation. While no simulation code currently provides these capabilities, the LAMMPS program comes closest by providing the ability to run both Class I and II force fields in the same simulation with massively parallel processing capability, but without the capability to fully utilize an interfacial force field (IFF) to independently control interphase behavior. The objectives of the proposed research are to (1) modify the LAMMPS molecular simulation program to develop the capability to independently implement an interfacial force field (IFF) to control interfacial behavior (LAMMPS/IFF), (2) benchmark the performance of LAMMPS/IFF for large-scale parallel processing, and (3) apply LAMMP/IFF to demonstrate the ability to accurate simulate protein-surface interactions. The development of this molecular simulation program has the potential to revolutionize current capabilities to accurately predict protein-surface interactions and to serve as a valuable tool for the design of the surfaces to control the bioactive state of surface-bound proteins."

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2011-IIF
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IIF - International Incoming Fellowships (IIF)

Coordinador

KING'S COLLEGE LONDON
Aportación de la UE
€ 151 020,69
Dirección
STRAND
WC2R 2LS London
Reino Unido

Ver en el mapa

Región
London Inner London — West Westminster
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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