Objectif
"A major question regarding climate change is whether species can respond to rapid climate change and avoid extinction. Here, we address this question by studying neutral and adaptive genetic variation in populations of the lichen-forming fungus Peltigera membranacea. Based on existing genome data (host lab), we identified hundreds of microsatellites (SSR) and 119 genes involved in fungal environmental stress responsea (ESR). Landscape-level patterns of gene movement will be studied with SSR markers, offering valuable insight on whether the species is likely to spread to sites with suitable conditions under climate change (landscape genetics). An experiment will shed light on whether gene expression differs when thalli are grown at high and low temperatures (experimental transcriptomics). The ESR genes will be investigated with Next Generation Sequencing to identify SNPs with an association to environmental variables to infer the species’ potential to adapt to the environment based on standing genetic variation within populations (landscape genomics). The results will clarify the response of lichen fungi to climate change, both in terms of the species’ potential for adaptation, tolerance of changed conditions, and spread of individuals to new sites.
By performing this fascinating research, the fellow will have the valuable opportunity to receive high quality training in bioinformatics including analysis of transcriptomes, genome annotation, and training in laboratory skills, i.e. isolation of high-quality mRNA and preparation of libraries for Solexa sequencing. A long-term collaboration will be established between the laboratories in Switzerland and Iceland, as a major step in building a pan-European researcher team working on population genomics of lichens (LICHENOMICS). This project will thus contribute to European excellence by strengthening a unique discipline involving numerous fascinating biological phenomena yet to be explored."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie mycologie ethnolichénologie
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement sciences de l'atmosphère climatologie changement climatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
101 Reykjavik
Islande
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.