Objetivo
The oncogenic human immunodeficiency virus (HIV) currently infects an estimated 33 million individuals and has claimed more than 25 million lives. The primary treatment of HIV consists of a cocktail of several classes of antiretroviral drugs targeting various components of the HIV virus. The most utilized target of antiretroviral drugs is reverse transcriptase (RT), an enzyme that transforms the viral genome from ssRNA to dsDNA. Unfortunately, significant gaps remain in our understanding of how RT functions. Using single molecule techniques, I have previously shown that the orientation of RT while associated with nucleic acids is highly dynamic and characterized by both flipping and sliding transitions. These transitions are associated with processing of the poly-purine tract (PPT) sequence, the rapid targeting of RT to the ends of long regions of double stranded nucleic acids, and strand displacement synthesis. In this grant, I propose to develop additional single molecule assays to further study the dynamic interactions of RT with physiologically relevant nucleic acid substrates. These new assays will allow my lab to address specific questions relevant to the understanding of this key enzyme. First, we will determine the mechanisms of the flipping and sliding transitions and test whether these transitions are required for the successful completion of key steps in the reverse transcription reaction. Second, we will probe the detailed mechanism of strand displacement synthesis and determine the energetic contacts RT uses to stabilize the annealed primer strand. Finally, we will also measure the effects of antiretroviral drugs in preventing the completion of individual steps of the reverse transcription process to identify potentially novel mechanisms of inhibition. Taken together, this research offer fundamental insights into protein and nucleic acid interactions and help to define the next generation of anti-HIV drugs.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas ácido nucleico
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma genoma vírico
- ciencias médicas y de la salud ciencias de la salud enfermedad infecciosa virus de ARN VIH
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas enzima
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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FP7-PEOPLE-2011-CIG
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinador
2628 CN DELFT
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.