Objectif
Recent genomics analyses have facilitated the discovery of a novel major class of stable transcripts, now called long non-coding RNAs (lncRNAs). A growing number of analyses have implicated lncRNAs in the regulation of gene expression, dosage compensation and imprinting, and there is increasing evidence suggesting the involvement of lncRNAs in various diseases such as cancer. Despite recent advances, however, the role of the large majority of lncRNAs remains unknown and there is current debate on what fraction of lncRNAs may just represent transcriptional noise. Moreover, despite a growing number of lncRNAs catalogues for diverse model species, we lack a proper understanding of how these molecules evolve across genomes. Evolutionary analyses of protein-coding genes have proved tremendously useful in elucidating functional relationships and in understanding how the processes in which they are involved are shaped during evolution. Similar insights may be expected from a proper evolutionary characterization of lncRNAs, although the lack of proper tools and basic knowledge of underlying evolutionary mechanisms are a sizable challenge. Here, I propose to combine state-of-the-art computational and sequencing techniques in order to elucidate what evolutionary mechanisms are shaping this enigmatic component of eukaryotic genomes.The first goal is to enable large-scale phylogenomic analyses of lncRNAs by developing, for these molecules, methodologies that are now standard in the evolutionary analysis of protein-coding genes. The second goal is to explore, at high levels of resolution, the evolutionary dynamics of lncRNAs across selected eukaryotic groups for which novel genome-wide data will be produced experimentally using recently developed sequencing techniques that enable obtaining genome-wide footprints of RNA secondary structure. Finally, this dataset will be used to test the impact on lncRNAs evolution of processes known to be important in protein-coding genes.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie de l'évolution
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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ERC-2012-StG_20111109
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
08003 Barcelona
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.