Objectif
Peptide-mediated protein interactions are emerging as key regulators of many important regulatory processes in the cell. Short motifs, usually embedded into disordered regions of the protein, interact with specific sets of protein partners in a transient way and allow efficient and malleable propagation of signals towards their targets. While regular protein interactions have been intensively studied, many aspects of peptide-mediated interactions have not yet been elucidated.
The aim of this proposal is to improve our understanding of the basic strategies that are employed by peptide-mediated interactions to achieve different types of outcomes in different settings, and how the context of the peptide influences this outcome. Towards this aim, we will establish two complementary strategies, namely (1) a significant extension of our modeling tools for peptide-protein complex structures that will allow modeling of effects of the surrounding flexible linker, and (2) the establishment of an experimental lab that will allow us to independently validate and complement our modeling results. Targeted modulation of peptide affinity, specificity, and linker length and sequence, using both computational design as well as experimental in vitro evolution, will dissect different contributions to the functional outcome of a peptide-mediated interaction within its context. We can thus study in detail the interplay of the interaction with additional features in the linker sequence, such as posttranslational modification sites, as well as additional peptide binding motifs and interactions.
Interactions mediated by intrinsically disordered regions are omnipresent. Their accurate characterization, modeling and manipulation holds therefore many promises towards applications for the development of better drugs and basic insights for better fundamental understanding of the underlying basis of regulatory interactions.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2012-StG_20111109
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
91904 JERUSALEM
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.