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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Cis-regulatory variation: Using natural genetic variation to dissect cis-regulatory control of embryonic development.

Objectif

Embryonic development is very robust: In the midst of segregating mutations and fluctuating environments, a fertilized egg has the remarkable capacity to give rise to a precisely patterned embryo. The stereotypic progression of development is driven by tightly regulated programs of gene expression. However, this deterministic view from genetics is at odds with an emerging view of transcription from genomics as a “noisy” process, variable and changing both within and between individuals. How variable transcriptional programs can regulate robust embryonic development remains a long-standing question, which this proposal aims to address. By combining population genetics, genomics, and developmental genetics in Drosophila we will dissect the relationship between DNA sequence variation, transcription factor (TF) occupancy, and the regulatory control of developmental gene expression.

The backdrop for this work is extensive information generated by my lab on the location and function of over 12,000 developmental cis-regulatory elements, including accurate, predictive models of their spatio-temporal activity. To understand the impact of variation on transcription and development, we will make use of a powerful experimental resource – 192 sequenced Drosophila strains, collected from a highly genetically diverse wild population. The proposed research has three Specific Aims: 1) Perform the first high-resolution study associating SNPs and structural variants (eQTLs) with gene expression variation during embryonic development, 2) Quantify in vivo the relationship between cis-regulatory variation, TF occupancy, and gene expression, 3) Incorporate these data into an integrated, predictive model of transcription. These Aims, together with our cis-regulatory data, will offer unique, mechanistic insights into how cis-regulatory variation impacts developmental gene regulation, and into the molecular bases of robustness in developmental regulatory networks.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

ERC-2012-ADG_20120314
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-AG - ERC Advanced Grant

Institution d’accueil

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Contribution de l’UE
€ 2 260 116,00
Adresse
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Allemagne

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Région
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Bénéficiaires (1)

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