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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-30

DNA-origami scaffolds for structure determination by single particle analysis

Objectif

Single-particle analysis of electron cryo-microscopy (cryo-EM) data can now provide near-atomic resolution information for large and high-symmetry protein complexes. However, application of the same method to small proteins is problematic, mainly because low signal-to-noise ratios hamper particle selection and orientation determination.

The proposed research aims to tackle this problem by binding proteins to large 3D scaffolds made of DNA origami. The main idea is to use a hollow rectangular frame (called DNA alignment frame) with a dsDNA helix (called rotation axis) spanning the interior hole of the frame. By using a specific sequence, DNA-binding proteins may be bound to the rotation axis in a specific manner. The orientation of the bound protein may then be controlled by exploiting the helical character of the rotation axis in a series of experiments where the position of the binding site on the rotation axis is varied. Thus, experimental information about the orientation of the protein may be obtained, which will be used as probabilistic priors in a statistical 3D reconstruction approach. Application of this procedure to E. coli MutS and the human Trf2/Rap1 complex will serve as proof-of-principle and may lead to better understanding of their function.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2012-IIF
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IIF - International Incoming Fellowships (IIF)

Coordinateur

MEDICAL RESEARCH COUNCIL
Contribution de l’UE
€ 221 606,40
Adresse
20 Park Crescent
W1B 1AL LONDON
Royaume-Uni

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Type d’activité
Public bodies (excluding Research Organisations and Secondary or Higher Education Establishments)
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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