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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-18

Mass spectrometry for nucleic acid biophysics : dealing with diversity

Objetivo

"There is now increasing evidence that specific nucleic acid structures modulate gene expression levels both at the transcriptional and at the translational level. In particular, G-quadruplex (G4) structures are attractive targets for anticancer strategies, since several studies showed that their stabilization by ligands caused proliferation arrest, telomere deprotection and changes in gene expression. Understanding the structure-function relationships in G4 DNA and RNA requires innovative biophysical tools to probe the general and specific features of the structures adopted by a wide variety of sequences, their macromolecular assemblies, and their interactions with small molecules. I propose here to develop native mass spectrometry and ion mobility spectrometry as biophysical tools to probe small molecule ligand interactions with G4 structures. My recent work on small (~20-30 bases) G4 models demonstrated that MS is uniquely well suited to detect and quantify G4-drug interactions in a direct binding assay. The objective of the present project is now to characterize not only the binding affinity and specificity but also the binding mode of ligands for a variety of DNA and RNA targets. Ion mobility spectrometry will be crucial for studying the conformational adaptability of the target, and ligand-induced conformational changes. The model targets will vary in sequence, but also in size. Indeed, one still widely unaddressed challenge is to account for the flanking sequences that can form secondary structures and tertiary structures interacting with the G4 and, in the case of genomic non-B-DNA targets, to include the adjacent and competing double-stranded DNA. The biophysical approaches developed here for a specific purpose (G4 ligands) will also be widely applicable to other nucleic acid targets."

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2012-CIG
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)

Coordinador

INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE
Aportación de la UE
€ 100 000,00
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
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