Obiettivo
"There is now increasing evidence that specific nucleic acid structures modulate gene expression levels both at the transcriptional and at the translational level. In particular, G-quadruplex (G4) structures are attractive targets for anticancer strategies, since several studies showed that their stabilization by ligands caused proliferation arrest, telomere deprotection and changes in gene expression. Understanding the structure-function relationships in G4 DNA and RNA requires innovative biophysical tools to probe the general and specific features of the structures adopted by a wide variety of sequences, their macromolecular assemblies, and their interactions with small molecules. I propose here to develop native mass spectrometry and ion mobility spectrometry as biophysical tools to probe small molecule ligand interactions with G4 structures. My recent work on small (~20-30 bases) G4 models demonstrated that MS is uniquely well suited to detect and quantify G4-drug interactions in a direct binding assay. The objective of the present project is now to characterize not only the binding affinity and specificity but also the binding mode of ligands for a variety of DNA and RNA targets. Ion mobility spectrometry will be crucial for studying the conformational adaptability of the target, and ligand-induced conformational changes. The model targets will vary in sequence, but also in size. Indeed, one still widely unaddressed challenge is to account for the flanking sequences that can form secondary structures and tertiary structures interacting with the G4 and, in the case of genomic non-B-DNA targets, to include the adjacent and competing double-stranded DNA. The biophysical approaches developed here for a specific purpose (G4 ligands) will also be widely applicable to other nucleic acid targets."
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole acidi nucleici
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biofisica
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze chimiche chimica analitica spettrometria di massa
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2012-CIG
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinatore
75654 PARIS
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.