Skip to main content
Aller à la page d’accueil de la Commission européenne (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)
français français
CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS
Contenu archivé le 2024-06-18

Beads on String Genomics: Experimental Toolbox for Unmasking Genetic / Epigenetic Variation in Genomic DNA and Chromatin

Objectif

Next generation sequencing (NGS) is revolutionizing all fields of biological research but it fails to extract the full range of information associated with genetic material and is lacking in its ability to resolve variations between genomes. The high degree of genome variation exhibited both on the population level as well as between genetically “identical” cells (even in the same organ) makes genetic and epigenetic analysis on the single cell and single genome level a necessity.
Chromosomes may be conceptually represented as a linear one-dimensional barcode. However, in contrast to a traditional binary barcode approach that considers only two possible bits of information (1 & 0), I will use colour and molecular structure to expand the variety of information represented in the barcode. Like colourful beads threaded on a string, where each bead represents a distinct type of observable, I will label each type of genomic information with a different chemical moiety thus expanding the repertoire of information that can be simultaneously measured. A major effort in this proposal is invested in the development of unique chemistries to enable this labelling.
I specifically address three types of genomic variation: Variations in genomic layout (including DNA repeats, structural and copy number variations), variations in the patterns of chemical DNA modifications (such as methylation of cytosine bases) and variations in the chromatin composition (including nucleosome and transcription factor distributions). I will use physical extension of long DNA molecules on surfaces and in nanofluidic channels to reveal this information visually in the form of a linear, fluorescent “barcode” that is read-out by advanced imaging techniques. Similarly, DNA molecules will be threaded through a nanopore where the sequential position of “bulky” molecular groups attached to the DNA may be inferred from temporal modulation of an ionic current measured across the pore.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

ERC-2013-StG
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Institution d’accueil

TEL AVIV UNIVERSITY
Contribution de l’UE
€ 1 627 600,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Bénéficiaires (1)

Mon livret 0 0