Objectif
Plants synthesize a vast array of natural products that serve crucial functions in protection against pests, as attractants for pollinators, as structural components and as signalling molecules. Such natural products offer a great potential for the development of new phyto-pharmaceuticals, biomaterials, and to enhance crop properties. But a fundamental pre-requisite for such biotechnological developments is a thorough understanding of the underlying biosynthetic pathways. Recent genome sequencing projects have revealed the existence of large gene families likely to encode the enzymes forming these pathways. The largest among them is the super-family of cytochrome P450 (CYP450) monooxygenases.
The size of this family reflects the complexity of plant secondary metabolism, and demonstrates that most of it is still unexplored. CYP450s often constitute rate-limiting steps and points-of-no-return in metabolic networks. They are thus under tight developmental control, and frequently respond transcriptionally to environmental cues. Here we propose a new integrative approach for the functional characterization of the orphan CYP450s in Arabidopsis. It combines bioinformatics with reverse genetics, metabolic profiling and reverse biochemistry. Based on large-scale expression data, co-expression analysis with known and putative metabolic genes will be exploited to place CYP450s onto existing metabolic pathways, and to identify novel metabolic networks.
Based on these results, selected CYP450 genes will be characterized u sing reverse genetics (over-expressers, knock out mutants) combined with targeted metabolic profiling. Employing an available collection of recombinant enzymes, biochemical functions will be identified, either directly or by using medium throughput enzymatic screening methods. We thereby hope to promote the field of natural product biosynthesis, and to develop a widely applicable strategy for characterizing large gene families and secondary pathways in plants.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie métabolomes
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2004-MOBILITY-12
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants
Coordinateur
STRASBOURG
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.