Objectif BaSysBio aims to achieve major breakthroughs in the understanding of the regulation of gene transcription in bacteria at a global scale. The highly dynamic gene regulation is mediated by transcription factors (TF) that trigger or repress the expression of their target genes. Transcription control is embedded into a hierarchical flow of information from genes to phenotype in which many regulatory steps can occur. BaSysBio adopts a systems biology approach in which quantitative experimental data will be generated for each step of the information flow, and will fuel computational modelling. High-throughput technologies (living cell arrays, tiling DNA microarrays, multidimensional liquid chromatography proteomics and quantitative metabolomics) will be developed in conjunction with new computational modelling concepts to facilitate the understanding of biological complexity. Models will simulate the cellular transcriptional responses to environmental changes and their impact on metabolism and proteome dynamics.The iterative process of simulations and model-driven targeted experiments will generate novel hypotheses about the mechanistic nature of dynamic cellular responses, unravel emerging systems properties, and ultimately provide an efficient roadmap to tackle novel, pathogenic organisms. This system-based strategy will enable BaSysBio i) to understand how transcriptional regulation and metabolism are quantitatively integrated at a global level; ii) to unravel cellular transcriptional responses in conditions mimicking pathogenesis.Finally, the project will validate the general applicability of the knowledge and integrated modelling-experimental strategy developed in the highly tractable B. subtilis model towards an understanding of regulatory networks controlling pathogenesis in disease-causing bacteria. BaSysBio will make a significant contribution towards overcoming the structural obstacles that hinder the development of systems biology in Europe. Champ scientifique natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsproteomicsnatural sciencesbiological sciencesmicrobiologybacteriologynatural sciencesbiological sciencesgeneticsDNA Programme(s) FP6-LIFESCIHEALTH - Life sciences, genomics and biotechnology for health: Thematic Priority 1 under the Focusing and Integrating Community Research programme 2002-2006. Thème(s) LSH-2005-1.1.1-1 - A systems approach to understanding the regulation of gene transcription Appel à propositions FP6-2005-LIFESCIHEALTH-6 Voir d’autres projets de cet appel Régime de financement IP - Integrated Project Coordinateur INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse 147, rue de l'Université PARIS France Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée Participants (16) Trier par ordre alphabétique Trier par contribution de l’UE Tout développer Tout réduire CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE France Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse 3, RUE MICHEL-ANGE PARIS Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Espagne Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse SERRANO 117 MADRID Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée ERNST-MORITZ-ARNDT-UNIVERSITAT GREIFSWALD Allemagne Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse DOMSTRASSE 11 GREIFSWALD Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée EIDGENOSSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZÜRICH Suisse Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse RAMISTRASSE 101 ZURICH Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée GENEDATA AG Suisse Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse MAULBEERSTRASSE, 46 248 BASEL Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée INSTITUT PASTEUR France Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse 25-28 RUE DU DR. ROUX PARIS Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée INRA TRANSFERT France Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse 10 RUE VIVIENNE PARIS Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée MAX PLANCK SOCIETY REPRESENTED BY MAX PLANCK INSTITUTE FOR MOLECULAR GENETICS Allemagne Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse IHNESTR. 73 BERLIN Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée UNIVERSITY HOSPITAL GRONINGEN Pays-Bas Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse HANZEPLEIN 1 30001 GRONINGEN Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée THE PROVOST,FELLOWS AND SCHOLARS OF THE COLLEGE OF THE HOLY AND UNDIVIDED TRINITY OF QUEEN Irlande Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse Trinity College Dublin DUBLIN Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée DANMARKS TEKNISKE UNIVERSITET (TECHNICAL UNIVERSITY OF DENMARK) Danemark Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse ANKER ENGELUNDSVEJ 1 LYNGBY Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée UNIVERSITY OF NEWCASTLE UPON TYNE Royaume-Uni Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse 6 Kensington Terrace NEWCASTLE UPON TYNE Voir sur la carte Coût total Aucune donnée UNIVERSITY OF YORK Royaume-Uni Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse Heslington YORK Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée THE UNIVERSITY OF NEWCASTLE AUSTRALIA Australie Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse UNIVERSITY DRIVE CALLAGHAN Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée HUMBOLDT-UNIVERSITAET ZU BERLIN Allemagne Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse Unter den Linden 6 BERLIN Voir sur la carte Coût total Aucune donnée APPLIED BIOSYSTEMS DEUTSCHLAND GMBH 2906702,00 3230077,00 Allemagne Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse Frankfurterstr. 129B DARMSTADT Voir sur la carte Liens Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée