Objectif
BaSysBio aims to achieve major breakthroughs in the understanding of the regulation of gene transcription in bacteria at a global scale. The highly dynamic gene regulation is mediated by transcription factors (TF) that trigger or repress the expression of their target genes. Transcription control is embedded into a hierarchical flow of information from genes to phenotype in which many regulatory steps can occur. BaSysBio adopts a systems biology approach in which quantitative experimental data will be generated for each step of the information flow, and will fuel computational modelling. High-throughput technologies (living cell arrays, tiling DNA microarrays, multidimensional liquid chromatography proteomics and quantitative metabolomics) will be developed in conjunction with new computational modelling concepts to facilitate the understanding of biological complexity. Models will simulate the cellular transcriptional responses to environmental changes and their impact on metabolism and proteome dynamics.
The iterative process of simulations and model-driven targeted experiments will generate novel hypotheses about the mechanistic nature of dynamic cellular responses, unravel emerging systems properties, and ultimately provide an efficient roadmap to tackle novel, pathogenic organisms. This system-based strategy will enable BaSysBio i) to understand how transcriptional regulation and metabolism are quantitatively integrated at a global level; ii) to unravel cellular transcriptional responses in conditions mimicking pathogenesis.
Finally, the project will validate the general applicability of the knowledge and integrated modelling-experimental strategy developed in the highly tractable B. subtilis model towards an understanding of regulatory networks controlling pathogenesis in disease-causing bacteria. BaSysBio will make a significant contribution towards overcoming the structural obstacles that hinder the development of systems biology in Europe.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2005-LIFESCIHEALTH-6
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.