Objectif
We propose to develop a model that unites viral population genetics and phylogenetics to investigate HIV transmission histories. This genealogy-based population genetic model will accommodate for variable population sizes within and between infected hosts, while taking into account phylogenetic relationships between the patients.
It is our objective to implement this model in a recently developed, highly flexible Bayesian framework and to validate this method on a comprehensive set of clonal sequences sampled over time from a well-documented HIV transmission chain. We aim to apply our novel approach to at least three well-characterized HIV transmission chains and to extend the application to other rapidly evolving virus populations.
This will allow us to estimate the strength and magnitude of the genetic bottleneck associated with viral transmission and to evaluate its impact on evolution at the population level. Thereby, we can address the switching of co-receptor usage within patients and the spread of immune-escape and drug resistance mutations in the HIV infected population. This research will also result in statistical methods that provide a more realistic description of viral evolution with important practical applications in viral epidemiology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- lettres histoire et archéologie histoire
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé santé publique et environnementale épidémiologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse virus à ARN VIH
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2005-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
OXFORD
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.