Objectif
All organisms, from bacteria to mammals, contain small RNAs (sRNAs) that participate in diverse cellular activities including RNA processing, mRNA stability, translation, etc. In the past few years, sRNAs have become one of the hottest topics with the discovery of novel classes of sRNAs and their involvement in regulatory processes (miRNAs/development, sRNA/bacterial stress responses, virulence, etc). In the enterobacterium E. coli, 50-250 sRNAs have been identified and/or predicted.
Of the few characterized so far, most acts as key post-transcriptional regulators by anti-sense mechanisms (base-pairing to target mRNA). These sRNAs regulate a variety of functions (e.g. from plasmid replication to bacterial virulence traits). Strikingly, most of them require the abundant Sm-like Hfq protein for activity, though its exact molecular mode of action is yet elusive.
The proposed project has two distinct, yet connected, goals:
1) Identification of new sRNA/target mRNA pairs in E. coli, and elucidation of the underlying regulatory processes.
2) Elucidation of the mechanism of action of the Hfq protein in sRNA-mediated regulation.
This project is multidisciplinary and involves experimental strategies from bioinformatics, molecular genetics and biology as well as advanced biochemistry. An elucidation of cellular functions of sRNAs in E. coli will aid our global understanding of their roles in gene regulation in all organisms and, in particular, in pathogenic bacteria. Furthermore, characterization of the role of H fq may provide functional clues relevant for similar proteins elsewhere (i.e. eukaryotic Sm-like proteins). Testifying to its importance, the field of sRNAs has received dramatically increased funding in the USA. Europe needs to take a lead in this area of high impact. The FP6 has recently recognized the general area of this project as being of high priority.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire génétique moléculaire
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques zoologie mammalogie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2005-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
UPPSALA
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.