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Contenuto archiviato il 2024-05-29

RNA-mediated regulation in bacteria: non-coding RNAs and the role of the ubiquitous Sm-like Hfq protein

Obiettivo

All organisms, from bacteria to mammals, contain small RNAs (sRNAs) that participate in diverse cellular activities including RNA processing, mRNA stability, translation, etc. In the past few years, sRNAs have become one of the hottest topics with the discovery of novel classes of sRNAs and their involvement in regulatory processes (miRNAs/development, sRNA/bacterial stress responses, virulence, etc). In the enterobacterium E. coli, 50-250 sRNAs have been identified and/or predicted.

Of the few characterized so far, most acts as key post-transcriptional regulators by anti-sense mechanisms (base-pairing to target mRNA). These sRNAs regulate a variety of functions (e.g. from plasmid replication to bacterial virulence traits). Strikingly, most of them require the abundant Sm-like Hfq protein for activity, though its exact molecular mode of action is yet elusive.

The proposed project has two distinct, yet connected, goals:
1) Identification of new sRNA/target mRNA pairs in E. coli, and elucidation of the underlying regulatory processes.
2) Elucidation of the mechanism of action of the Hfq protein in sRNA-mediated regulation.

This project is multidisciplinary and involves experimental strategies from bioinformatics, molecular genetics and biology as well as advanced biochemistry. An elucidation of cellular functions of sRNAs in E. coli will aid our global understanding of their roles in gene regulation in all organisms and, in particular, in pathogenic bacteria. Furthermore, characterization of the role of H fq may provide functional clues relevant for similar proteins elsewhere (i.e. eukaryotic Sm-like proteins). Testifying to its importance, the field of sRNAs has received dramatically increased funding in the USA. Europe needs to take a lead in this area of high impact. The FP6 has recently recognized the general area of this project as being of high priority.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2005-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinatore

UPPSALA UNIVERSITET
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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