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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-29

Generation and analysis of a domain based interaction map of C. elegans early embryogenesis

Objectif

Macromolecular interactions, such as those between proteins, form the basis of all biological activity. Here, we propose to map the interactions between 800 proteins involved in early embryonic development of the nematode Caenorhabditis elegans. These proteins are involved in core processes common to all multicellular organisms. To generate the network, a novel application of the yeast two-hybrid system will be used, that yields several improvements compared to current interaction datasets. First, it will lower the false negative rate, increasing the fraction of interactions identified. Second, it will identify the domains required for each interaction. Most protein interactions occur between specific protein domains. For an accurate representation of interaction networks, this information should be captured. It will enable us, for example, to know whether two interactions may take place simultaneously, or are mutually exclusive because they are mediated by the same domain. Finally, the domain interaction map will be integrated with existing phenotypic characterizations and expression profiles to be able to better predict the biological functions of the proteins in the network.

The resulting combined network will be used to gain a better understanding of multicellular development. We are using C. elegans as a model system because it is a relatively simple, tractable multicellular organism, and powerful genetic tools are available to study components of interaction networks in vivo. We will focus on candidate novel components involved in asymmetric cell division and polarity establishment, and on proteins with human homologs that are implicated in disease. The interaction network will also be publicly available. Because of the conserved nature of the proteins involved, the interaction network and future results derived from it will be valuable not only to C. elegans researchers but to researchers in other fields as well.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2004-MOBILITY-12
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants

Coordinateur

UNIVERSITEIT UTRECHT
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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