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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-29

Analysis of candidate genes for the susceptibility to lung cancer in patients under 50 years old

Objectif

There is much interest on whether some individuals are more genetically susceptible than others to developing lung cancer. Genetic polymorphisms in genes involved in the metabolism of tobacco, DNA repair, cell cycle control, and nicotine addiction are ca ndidate to determine such a susceptibility. A tool to study the genetic susceptibility is to carry out case-control association studies with a high quality information on lifestyle and to have high-throughput technologies for genotyping a broad selection of genes. During the MCF fellowship period, we set up an oligonucleotide micro-array based on arrayed primer extension technology (APEX) that allows the parallel high-throughput genotyping of 158 single nucleotide polymorphisms in 51 candidate genes. T he genes are reported as follows: ADH1B, ALDH2, APE1, CDKN2A, COMT, CYP1A1, CYP1A2, CYP1B1, CYP2A6, CYP2C19, CYP2C9, CYP2D6, CYP2E1, CYP3A4, DRD2, DRD4, EPHX1, ERCC1, ERCC2, ERCC4, ERCC5, GRPR, GSTA2, GSTA4, GSTM1, GSTM3, GSTP1, GSTT2, LIG3, MDM2, MGMT, MnSOD2, MPO, MPC, MTHFR, NATI, NAT2, NQO1, OGGI, CDKN1A, PCNA, POLB, SLC6A3, SULT1A1, TP53, TPMT, UGT1A7, XRCC1, XRCC2, XRCC3, XRCC9. We called this microarray \"MetaboChip\" and we have already validated it by genotyping a standard reference sample se t (SNP500 from NCI). Now, we are aiming to use MetaboChip to genotype a cohort of DNA samples (310 patients, 310 controls) who are part of a larger multicentric case-control study. To better investigate the role of genetics, we will focus on patients who developed the disease before the age of 50 years. Most of the polymorphisms included in MetaboChip are demonstrated to have a biological significance and the study will allow testing hypothesis of the interaction between tobacco-smoke and genotypes (hyp othesis testing). Moreover, part of the SNPs will be just explored, as there is not information about their functional role.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2002-MOBILITY-11
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERG - Marie Curie actions-European Re-integration Grants

Coordinateur

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI PISA
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Adresse
Lungarno Pacinotti 43-44
PISA
Italie

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Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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