Objectif
Determination of the sequence of the human genome, and knowledge of the genetic code through which mRNA is translated have allowed rapid progress in identification of mammalian proteins. However, less is known about the molecular mechanisms that control expression of human genes, and about the variations in gene expression that underlie many pathological states, including cancer. This is caused in part by lack of information about the 'second genetic code' - binding specificities of transcription factors (TFs).Deciphering this regulatory code is critical for cancer research, as little is known about the mechanisms by which the known genetic defects induce the transcriptional programs that control cell proliferation, survival and angiogenesis. In addition, changes in binding of transcription factors caused by single nucleotide polymorphisms (SNPs) are likely to be a major factor in many quantitative trait conditions, including familial predisposition to cancer. We aim to develop novel genomics tools and methods for determination of transcription factor binding specificity. These tools will be used for identification of regulatory SNPs that predispose to colorectal cancer, and for characterization of downstream target genes that are common to multiple oncogenic TFs. Specific aims: 1. To develop novel high throughput multiwell-plate and DNA-chip based methods for determining TF binding specificity 2. To experimentally determine the binding specificities of known cancer-associated TFs 3. To computationally predict and experimentally verify elements regulated by these TFs in genes essential for cell proliferation. 4. To develop a SNP genotyping chip composed of SNPs that affect the function of TF-binding sites conserved in mammalian species. 5. To use this chip for genotyping of patients with hereditary cancer predisposition as well as controls in three European populations, for identification of regulatory SNPs associated with cancer.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie cancer colorectal
- sciences naturelles sciences biologiques génétique nucléotide
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2003-LIFESCIHEALTH-I
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
HELSINGIN YLIOPISTO, HELSINKI
Finlande
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.