Obiettivo
Determination of the sequence of the human genome, and knowledge of the genetic code through which mRNA is translated have allowed rapid progress in identification of mammalian proteins. However, less is known about the molecular mechanisms that control expression of human genes, and about the variations in gene expression that underlie many pathological states, including cancer. This is caused in part by lack of information about the 'second genetic code' - binding specificities of transcription factors (TFs).Deciphering this regulatory code is critical for cancer research, as little is known about the mechanisms by which the known genetic defects induce the transcriptional programs that control cell proliferation, survival and angiogenesis. In addition, changes in binding of transcription factors caused by single nucleotide polymorphisms (SNPs) are likely to be a major factor in many quantitative trait conditions, including familial predisposition to cancer. We aim to develop novel genomics tools and methods for determination of transcription factor binding specificity. These tools will be used for identification of regulatory SNPs that predispose to colorectal cancer, and for characterization of downstream target genes that are common to multiple oncogenic TFs. Specific aims: 1. To develop novel high throughput multiwell-plate and DNA-chip based methods for determining TF binding specificity 2. To experimentally determine the binding specificities of known cancer-associated TFs 3. To computationally predict and experimentally verify elements regulated by these TFs in genes essential for cell proliferation. 4. To develop a SNP genotyping chip composed of SNPs that affect the function of TF-binding sites conserved in mammalian species. 5. To use this chip for genotyping of patients with hereditary cancer predisposition as well as controls in three European populations, for identification of regulatory SNPs associated with cancer.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia tumore del colon-retto
- scienze naturali scienze biologiche genetica nucleotidi
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2003-LIFESCIHEALTH-I
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
HELSINGIN YLIOPISTO, HELSINKI
Finlandia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.