Objectif
Plant cells are surrounded by a strong wall composed mainly of polysaccharides. This wall is essential for the form of the plant and allows the plant to stand upright, and the wall is the first line of defence against invading pathogens. Very little is known about how the wall polysaccharides are formed and integrated into the wall. Many enzymes are necessary for biosynthesis of the polysaccharides; the majority are glycosyltransferases (GTs) but also transglycosidases are involved.
The overall objective of the project is to assign function to genes involved in the biogenesis of plant cell wall polysaccharides. A functional genomics strategy will be pursued using Arabidopsis thaliana as the model:
1) Development and use of bioinformatics to predict which open reading frames are involved in cell wall biosynthesis.
2) Reverse genetics. A high throughput approach will allow investigation of at least 100 GTs. Clones will be produced in GateWay entry vectors for the easy sub-cloning in vectors for expression, epitope tagging etc. The activities of heterologously expressed enzymes will be determined using assays developed in the project.
3) Novel analytical tools for characterization of polysaccharides in the mutants will be developed and applied including antibodies and carbohydrate binding modules for in situ polysaccharide analysis, mass spectrometry, polysaccharide sequencing, substrate-chips for surface plasmon resonance, glyco-chips for activity screening etc.
4) Protein-protein interactions between the identified enzymes and other proteins will be investigated by proteomics, epitope tagging and bioimaging.
The network consists of 10 partners from 7 countries and will provide an outstanding environment for training of young researchers. In addition to the training implied in carrying out a challenging research project with frequent exchange between the partner laboratories, the network will implement a formal training program consisting of courses and workshops.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule glucides
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2002-MOBILITY-1
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
KØBENHAVN K.
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.