Objectif
Molecular diagnostics of microbial pathogens is an integral part of modern medicine. The growing need for direct genotyping and/or the screening of the transcriptome calls for the development of alternative technologies. The STREP consortium plans to devel op a cost-effective platform for the identification bacterial species based on the SLIC-Nanobiosystem. Using tmRNA transcripts of the bacterial ssrA gene, we will be able to detect, quantify and identify bacterial species in a single homogenous assay forma t. The SLIC-Nanobiosystem consists of a self-assembled lipid bilayer membrane that integrates a synthetic ligand-gated ion channel (SLIC). The SLIC comprises a capture molecule that can specifically bind a given analyte, a process that is monitored via ele ctrical impedance spectroscopy. With this system the effect from even a few channels can be resolved thus providing an ultra-sensitive, highly stable and versatile biosensor platform. We intend to employ transcripts (tmRNA) of the ssrA gene in order to ide ntify bacterial species present in clinical samples. These transcripts occur in high abundance and contain a core sequence that is species specific, a feature which will be exploited to identify infectious disease pathogens. Identification of the different bacterial tmRNA transcripts will be accomplished by displaying a library of nucleic acid capture probes on the SLIC. This will enable species identification and discrimination between one or more species present in the sample if mixed species infection is present. Since the detection equipment will be based on electronics, the realization of miniaturized/compact and cost-effective instruments will be possible. Our approach will lay the foundation for a new generation of multiparametric molecular testing sy stems, that will open novel opportunities within the area of point-of-care applications in the clinical diagnostics market.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie découverte de médicaments
- ingénierie et technologie génie électrique, génie électronique, génie de l’information ingénierie électronique capteurs biocapteurs
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule acide nucléique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2003-LIFESCIHEALTH-I
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
LAUSANNE
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.