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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-05-29

Definition of the protein components of the FCA/FY complex in Arabidopsis thaliana

Objectif

The autonomous promotion pathway plays a major role in controlling the floral transition in Arabidopsis. Its main function is to down-regulate RNA levels of the floral repressor, FLC. The Dean lab has cloned two components of this pathway, FCA and FY, which encode an RNA-binding protein and a homologue of a yeast protein required for mRNA 3'-end-processing and polyadenylation respectively. They have recently shown that FCA/FY proteins interact physically and regulate the alternative processing of the FCA tr anscript. Since FCA has no homology to any known component of the core polyadenylation machinery, it might be a regulator of 3'-end formation, whereas FY seems to be a conserved component of the 3'-end processing machinery.

The characterization of Arabidop sis FCA/FY complex will help to elucidate general questions about the composition of complexes regulating RNA 3'-end formation in eukaryotes. We expect to define the components of the FCA/FY complex by means of multidisciplinary proteomic approaches. The FY yeast homologue (Pfs2p) interacts with Yshlp, Fiplp, and RNA14p. We shall first clone Arabidopsis orthologues of Yshlp, Fiplp, and RNA14p, and we will test if the FY protein interacts with them by GST pull-down assay. Secondly, we will also identify other components of the FCA/FY complex by yeast two-hybrid experiments using FY as a bait.

Positive clones will be cloned into His-tagged vectors for efficient in vitro transcription/translation and co-immunoprecipitation experiments will be carried out with GS T-tagged FY protein. Finally,we will express FCA and FY-tagged proteins with TAP and HA epitopes in cultured Arabidopsis cells (both under the control of 35S and native promoters) and in Arabidopsis transgenic plants (under the control of native promoters) for the purification of the FCA/FY complex by affinity chromatography. We will identify these components by MudPIT. This methodology is now well established in Dean's lab.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinateur

JOHN INNES CENTRE
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Adresse
Norwich Research Park, Colney
NORWICH
Royaume-Uni

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Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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