Obiettivo
The autonomous promotion pathway plays a major role in controlling the floral transition in Arabidopsis. Its main function is to down-regulate RNA levels of the floral repressor, FLC. The Dean lab has cloned two components of this pathway, FCA and FY, which encode an RNA-binding protein and a homologue of a yeast protein required for mRNA 3'-end-processing and polyadenylation respectively. They have recently shown that FCA/FY proteins interact physically and regulate the alternative processing of the FCA tr anscript. Since FCA has no homology to any known component of the core polyadenylation machinery, it might be a regulator of 3'-end formation, whereas FY seems to be a conserved component of the 3'-end processing machinery.
The characterization of Arabidop sis FCA/FY complex will help to elucidate general questions about the composition of complexes regulating RNA 3'-end formation in eukaryotes. We expect to define the components of the FCA/FY complex by means of multidisciplinary proteomic approaches. The FY yeast homologue (Pfs2p) interacts with Yshlp, Fiplp, and RNA14p. We shall first clone Arabidopsis orthologues of Yshlp, Fiplp, and RNA14p, and we will test if the FY protein interacts with them by GST pull-down assay. Secondly, we will also identify other components of the FCA/FY complex by yeast two-hybrid experiments using FY as a bait.
Positive clones will be cloned into His-tagged vectors for efficient in vitro transcription/translation and co-immunoprecipitation experiments will be carried out with GS T-tagged FY protein. Finally,we will express FCA and FY-tagged proteins with TAP and HA epitopes in cultured Arabidopsis cells (both under the control of 35S and native promoters) and in Arabidopsis transgenic plants (under the control of native promoters) for the purification of the FCA/FY complex by affinity chromatography. We will identify these components by MudPIT. This methodology is now well established in Dean's lab.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2002-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
NORWICH
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.