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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

The influence of DNA sequence on the epigenome

Objectif

Epigenetic regulation of transcription has emerged as a fundamental mechanism in developmental biology, stem cell biology and reprogramming and is frequently impaired in disease. Owing to recent advances in sequencing technology the genome wide distribution of epigenetic marks in different biological settings is being defined in unprecedented detail. Functional chromatin domains display distinct epigenetic marks and a variety of enzymatic activities depositing these marks has been identified. However, the mechanisms that determine locus specific setup of chromatin domains and their significance are incompletely understood. The proposed project is designed to shed light on the molecular mechanisms directing DNA methylation and histone modifications to specific loci. Using locus-specific integration of foreign DNA sequences with different base compositions and lengths, coupled to state of the art chromatin immunoprecipitation assays, DNA sequence determinants of de novo methylation and histone modifications will be explored. In a complementary approach, DNA pulldown assays coupled to mass spectrometry will be used to identify binding proteins of the respective sequences. In particular, I will analyze sequence motifs containing runs of A/T base pairs that are bound by AT-hook domains. AT-runs are a widespread sequence motif and a large number of DNA/chromatin binding proteins contain AT-hook domains, but their role in shaping the epigenome remains largely elusive to date. Our approach will not only identify new factors that contribute to the setup of the epigenome, but also yield valuable insights into the interplay between DNA binding proteins and chromatin modifiers that results in the specificity of the epigenomic landscape.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2013-IEF
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinateur

THE UNIVERSITY OF EDINBURGH
Contribution de l’UE
€ 221 606,40
Adresse
OLD COLLEGE, SOUTH BRIDGE
EH8 9YL Edinburgh
Royaume-Uni

Voir sur la carte

Région
Scotland Eastern Scotland Edinburgh
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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