Objetivo
The demonstration of induced pluripotency and direct lineage conversion of cells has led to remarkable insights regarding the roles of epigenetic modifications in mediating cell state transitions. However, approaches to elucidate the molecular mechanisms behind induced reprogramming are hindered by the inefficiency of induction and the interplay of reprogramming mechanisms with other cellular processes such as the cell cycle, which leads to variability in induced cell populations and limits the conclusiveness of bulk analyses. Here I propose to develop mass cytometry-based methods to monitor mRNA levels and gene locus-specific epigenetic modifications in single-cells. Thereby, the multi-dimensionality of mass cytometry will enable simultaneous measurements of up to 40 additional single-cell parameters, such as surface markers and intracellular phosphorylation sites. This platform will be used to profile cell populations at specific time-points during reprogramming of human somatic cells into induced pluripotent stem cells. The obtained data will be organized into clusters of similar cell phenotypes resulting in continuous single-cell maps that chart epigenetic changes and accompanying marker expressions during induced reprogramming. These maps will then serve as references to monitor the effects of chromatin-modifying small molecules that affect the efficiency of reprogramming. In combination, these analyses will lead to a more detailed understanding of the hierarchical and dynamic organization of reprogramming and will ideally define gene locus-specific epigenetic events that are rate-limiting for the process. This fine-grained view of reprogramming will then be used to define minimal combinations of early cellular markers that are likely to predict cell fate. In the final stage of the project, long-term single-cell imaging will be used to monitor cells with these previously defined properties to confirm their specific clonal future with absolute certainty.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias médicas y de la salud biotecnología médica tecnologías celulares células madre
- ciencias naturales ciencias biológicas genética epigenética
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-2013-IOF
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
8092 Zuerich
Suiza
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.