Description du projet
Identification des mécanismes de régulation de la pathogenèse bactérienne et de la résistance aux antimicrobiens
Le contrôle de l’expression génétique par les bactéries joue un rôle déterminant dans la prise en charge des maladies infectieuses et dans la lutte contre la résistance aux antimicrobiens. Si la régulation par les ARN non codants est bien connue, le potentiel d’utilisation des régions 3’ non traduites (3’-UTR) des ARN messagers et des protéines de liaison à l’ARN reste largement inexploré. Le projet ReguloBac-3UTR, financé par le CER, entend mener des études in vivo à haut débit afin d’étudier les mécanismes de régulation post-transcriptionnelle médiés par des 3’-UTR bactériens. Plus précisément, il sera axé sur l’identification et la caractérisation des 3’-UTR régulateurs chez les bactéries, notamment chez Staphylococcus aureus, un agent pathogène potentiellement mortel. Le projet vise également à démontrer l’évolution de ces régulateurs et leur impact sur la création de systèmes de régulation post-transcriptionnelle spécifiques à chaque espèce. Il permettra de découvrir la spécificité fonctionnelle et la régulation post-transcriptionnelle d’une famille largement répandue de protéines de liaison à l’ARN.
Objectif
In eukaryotes, untranslated regions located at the 3′ end (3’UTRs) of messenger RNAs (mRNAs) have been proved to be key post-transcriptional regulatory elements controlling almost every single biological process. In contrast, in bacteria, most studies regarding post-transcriptional regulation have been mainly focused on specific non-coding RNAs and 5’UTRs, which often carry riboswitches or thermosensors. Remarkably, bacterial 3’UTRs have been largely disregarded and have not been considered as potential regulators. Recently, we found that a 3’UTR modulates biofilm formation in S. aureus through its interaction with the 5’UTR encoded in the same mRNA. This mechanism resembles eukaryotic mRNA circularization. Also, a 3’UTR that contributes to cellular homeostasis by promoting hilD mRNA turnover was recently shown in Salmonella. Although both studies are pioneering showing the potential of bacterial 3’UTRs as regulatory elements, many questions still remain to be answered. Are 3’UTRs roles conserved in bacterial species? Do 3’UTRs contain specific regulatory sequences or secondary RNA structures? Are transcriptional terminator sequences relevant for certain 3’UTRs? Are 3’UTRs specifically recognized by RNA-binding proteins? Might 3’UTRs be responsible for bacterial speciation? Might bacterial 3’UTRs be the ancestors of eukaryotic 3’UTR evolution? To achieve these questions, here we propose a high-throughput analysis based on the development of specialized dual-reporter libraries to identify in vivo functional 3’UTRs by fluorescence-activated cell sorting coupled to RNA sequencing. Also the pool of RNA-binding proteins associated to 3’UTRs will be identified by global MS2-tagging and mass spectrometry. Examples of 3’UTRs belonging to physiologically important genes will be selected to deeply study regulatory mechanisms at the molecular and single cell levels. We expect that this project will largely change the view of post-transcriptional regulation in bacteria.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments résistance aux antibiotiques
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie homéostasie
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Nous sommes désolés... Une erreur inattendue s’est produite.
Vous devez être authentifié. Votre session a peut-être expiré.
Merci pour votre retour d'information. Vous recevrez bientôt un courriel confirmant la soumission. Si vous avez choisi d'être informé de l'état de la déclaration, vous serez également contacté lorsque celui-ci évoluera.
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2014-CoG
Voir tous les projets financés au titre de cet appelInstitution d’accueil
La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
28006 MADRID
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.