High-throughput in vivo studies on posttranscriptional regulatory mechanisms mediated by bacterial 3'-UTRs

Informations projet

ReguloBac-3UTR

N° de convention de subvention: 646869

DOI

10.3030/646869

Projet clôturé

Date de signature de la CE 15 Juin 2015

Date de début 1 Septembre 2015

Date de fin 31 Août 2020

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 876 778,00

Contribution de l’UE

€ 1 876 778,00

Coordonné par

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Spain

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Publications

Peer reviewed articles (10)

RNA thermoswitches modulate Staphylococcus aureus adaptation to ambient temperatures

Auteurs: Arancha Catalan-Moreno, Marta Cela, Pilar Menendez-Gil, Naiara Irurzun, Carlos J. Caballero, Isabelle Caldelari and Alejandro Toledo-Arana
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 49/6, 2021, Page(s) 3409-3426, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab117

Staphylococcus aureus ftnA 3’-untranslated region modulates ferritin production facilitating growth under iron starvation conditions

Auteurs: Pilar Menendez-Gil, Arancha Catalan-Moreno, Carlos J. Caballero and Alejandro Toledo-Arana
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 13, 2022, Page(s) 838042, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2022.838042

The regulon of the RNA chaperone CspA and its auto-regulation in Staphylococcus aureus

Auteurs: Carlos J Caballero, Pilar Menendez-Gil, Arancha Catalan-Moreno, Marta Vergara-Irigaray, Begoña García, Víctor Segura, Naiara Irurzun, Maite Villanueva, Igor Ruiz de los Mozos, Cristina Solano, Iñigo Lasa, Alejandro Toledo-Arana
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 46/3, 2018, Page(s) 1345-1361, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkx1284

Noncontiguous operon is a genetic organization for coordinating bacterial gene expression

Auteurs: S. Sáenz-Lahoya, N. Bitarte, B. García, S. Burgui, M. Vergara-Irigaray, J. Valle, C. Solano, A. Toledo-Arana, I. Lasa
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 116/5, 2019, Page(s) 1733-1738, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1812746116

A multifaceted small RNA modulates gene expression upon glucose limitation in Staphylococcus aureus

Auteurs: Delphine Bronesky, Emma Desgranges, Anna Corvaglia, Patrice François, Carlos J Caballero, Laura Prado, Alejandro Toledo‐Arana, Inigo Lasa, Karen Moreau, François Vandenesch, Stefano Marzi, Pascale Romby, Isabelle Caldelari
Publié dans: The EMBO Journal, Numéro 38/6, 2019, ISSN 0261-4189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.201899363

Advances in bacterial transcriptome understanding: From overlapping transcription to the excludon concept

Auteurs: Alejandro Toledo‐Arana, Iñigo Lasa
Publié dans: Molecular Microbiology, Numéro 113/3, 2020, Page(s) 593-602, ISSN 0950-382X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mmi.14456

Differential evolution in 3′UTRs leads to specific gene expression in Staphylococcus

Auteurs: Pilar Menendez-Gil, Carlos J Caballero, Arancha Catalan-Moreno, Naiara Irurzun, Inigo Barrio-Hernandez, Isabelle Caldelari, Alejandro Toledo-Arana
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 48/5, 2020, Page(s) 2544-2563, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa047

One evolutionarily selected amino acid variation is sufficient to provide functional specificity in the cold shock protein paralogs of Staphylococcus aureus

Auteurs: Arancha Catalan‐Moreno, Carlos J. Caballero, Naiara Irurzun, Sergio Cuesta, Jacinto López‐Sagaseta, Alejandro Toledo‐Arana
Publié dans: Molecular Microbiology, Numéro 113, 2020, Page(s) 826-840, ISSN 0950-382X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/mmi.14446

Regulation of Heterogenous LexA Expression in Staphylococcus aureus by an Antisense RNA Originating from Transcriptional Read-Through upon Natural Mispairings in the sbrBIntrinsic Terminator

Auteurs: Laurène Bastet, Pilar Bustos-Sanmamed, Arancha Catalan-Moreno, Carlos J. Caballero, Sergio Cuesta, Leticia Matilla-Cuenca, Maite Villanueva, Jaione Valle, Iñigo Lasa and Alejandro Toledo-Arana
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 23, 2022, Page(s) 576, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms23010576

Bacterial 3′UTRs: A Useful Resource in Post-transcriptional Regulation

Auteurs: Pilar Menendez-Gil, Alejandro Toledo-Arana
Publié dans: Frontiers in Molecular Biosciences, Numéro 7, 2021, ISSN 2296-889X
Éditeur: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fmolb.2020.617633

Conference proceedings (6)

An antisense RNA connects SOS-response to cellular stress

Auteurs: L. Bastet, C. Caballero, M. Villanueva, I. Lasa y A. Toledo-Arana
Publié dans: FEMS 2017: 7th Congress of European Microbiologists, Numéro 1, 2017
Éditeur: FEMS

Identification and characterization of RNA-binding proteins in Staphylococcus aureus

Auteurs: A. Catalán, C. Caballero and A. Toledo-Arana
Publié dans: FEMS 2017: 7th Congress of European Microbiologists, Numéro 1, 2017
Éditeur: FEMS

3’UTRs: new post-transcriptional regulatory elements in bacteria

Auteurs: P. Menéndez-Gil, C. Caballero and A. Toledo-Arana
Publié dans: FEMS 2017: 7th Congress of European Microbiologists, Numéro 1, 2017
Éditeur: FEMS

Evolución diferencial de las 3'UTRs en bacterias

Auteurs: P. Menendez-Gil, C. Caballero, A. Toledo-Arana
Publié dans: XI Molecular Microbiology Meeting of the Spanish Society of Microbiology, Numéro 1, 2016
Éditeur: SEM

Caracterización funcional de las chaperonas de RNA en Staphylococcus aureus

Auteurs: C. Caballero, A. Catalán Moreno, M. Vergara-Irigaray, B. García, C. Solano Goñi, I. Lasa, A. Toledo-Arana
Publié dans: XI Molecular Microbiology Meeting of the Spanish Society of Microbiology, Numéro 1, 2016
Éditeur: SEM

Un tránscrito antisentido conecta el estrés celular con la respuesta SOS

Auteurs: L. Bastet, C. Caballero, M. Villanueva, I. Lasa, A. Toledo-Arana
Publié dans: XI Molecular Microbiology Meeting of the Spanish Society of Microbiology, Numéro 1, 2016
Éditeur: SEM

Book chapters (1)

Fluorescent Molecular Beacons Mimicking RNA Secondary Structures to Study RNA Chaperone Activity

Auteurs: Pilar Menendez-Gil, Carlos J. Caballero, Cristina Solano, Alejandro Toledo-Arana
Publié dans: RNA Chaperones - Methods and Protocols, Numéro 2106, 2020, Page(s) 41-58, ISBN 978-1-0716-0230-0
Éditeur: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-0231-7_3