Synthetic platforms for ad libitum remodelling of yeast central metabolism

Informations projet

AdLibYeast

N° de convention de subvention: 648141

DOI

10.3030/648141

Projet clôturé

Date de signature de la CE 20 Mai 2015

Date de début 1 Septembre 2015

Date de fin 31 Août 2020

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 149 717,50

Contribution de l’UE

€ 2 149 717,50

Coordonné par

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Netherlands

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (9)

The genetic makeup and expression of the glycolytic and fermentative pathways are highly conserved within the Saccharomyces genus

Auteurs: Francine J. Boonekamp, Sofia Dashko, Marcel van den Broek, Thies Gehrmann, Jean-Marc Daran, Pascale Daran-Lapujade
Publié dans: Frontiers in Genetics, 2018, ISSN 1664-8021
Éditeur: Frontiers Media

Synthetic chromosomes as new tools for large scale engineering of metabolism

Auteurs: Eline Postma, Else Jasmijn Hassing, Venda Mangkusaputra, Jordi Geelhoed, Pilar de la Torre, Marcel van den Broek, Cristiaan Mooiman, Martin Pabst, Jean-Marc Daran, Pascale Daran-Lapujade
Publié dans: Metabolic Engineering, 2021, ISSN 1096-7176
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1101/2021.10.04.462994

A supernumerary designer chromosome for modular in vivo pathway assembly in Saccharomyces cerevisiae

Auteurs: Eline Postma, Sofia Dashko, Lucas van Breemen, Shannara Taylor Parkins, Marcel van den Broek, Jean-Marc Daran, Pascale Daran-Lapujade
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press

Pathway swapping: Toward modular engineering of essential cellular processes

Auteurs: Niels G. Kuijpers, Daniel Solis-Escalante, Marijke A.H. Luttik, Markus M.M. Bisschops, Francine J. Boonekamp, Marcel van den Broek, Jack T Pronk, Jean-Marc Daran, Pascale Daran-Lapujade
Publié dans: Proceeding of the National Academy of Science USA, 2016, ISSN 1091-6490
Éditeur: National Academy of Sciences of the United States of America

Top-down, knowledge-based genetic reduction of yeast central carbon metabolism

Auteurs: Eline Postma, Lucas Couwenberg, Roderick van Roosmalen, Jordi Geelhoed, Philip de Groot, Pascale Daran-Lapujade
Publié dans: mBio, 2021, ISSN 2150-7511
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1101/2021.08.24.457526

A toolkit for rapid CRISPR-SpCas9 assisted construction of hexose-transport-deficient Saccharomyces cerevisiae strains

Auteurs: Melanie Wijsman, Michał A Świat, Wesley L Marques, Johanna K Hettinga, Marcel van den Broek, Pilar de la Torre Cortés, Robert Mans, Jack T Pronk, Jean-Marc Daran, Pascale Daran-Lapujade
Publié dans: FEMS Yeast Research, 2018, ISSN 1567-1364
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/femsyr/foy107

FnCpf1: a novel and efficient genome editing tool for Saccharomyces cerevisiae

Auteurs: Michal A. Świat, Sofia Dashko, Maxime den Ridder, Melanie Wijsman, John van der Oost, Jean-Marc Daran, Pascale Daran-Lapujade
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 45/21, 2017, Page(s) 12585-12598, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkx1007

The Crabtree Effect Shapes the Saccharomyces cerevisiae Lag Phase during the Switch between Different Carbon Sources

Auteurs: Gemma Perez-Samper, Bram Cerulus, Abbas Jariani, Lieselotte Vermeersch, Nuria Barrajón Simancas, Markus M. M. Bisschops, Joost van den Brink, Daniel Solis-Escalante, Brigida Gallone, Dries De Maeyer, Elise van Bael, Tom Wenseleers, Jan Michiels, Kathleen Marchal, Pascale Daran-Lapujade, Kevin J. Verstrepen
Publié dans: mBio, Numéro 9/5, 2018, ISSN 2150-7511
Éditeur: ASM
DOI: 10.1128/mBio.01331-18

Design and experimental evaluation of a minimal, innocuous watermarking strategy to distinguish near-identical DNA and RNA sequences

Auteurs: Francine J. Boonekamp, Sofia Dashko, Donna Duiker, Thies Gehrmann, Marcel van den Broek, Maxime den Ridder, Martin Pabst, Vincent Robert, Thomas Abeel, Eline Postma, Jean-Marc Daran, Pascale Daran-Lapujade
Publié dans: ACS Synthetic Biology, 2020, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society

Thesis and dissertations (2)

Modular engineering of synthetic glycolytic pathways in Saccharomyces cerevisiae

Auteurs: Francine J. Boonekamp
Publié dans: 2021
Éditeur: Delft University of Technology

Single-step in vivo assembly of synthetic chromosomes with a modular design for engineering yeast metabolism

Auteurs: Eline Postma
Publié dans: 2021
Éditeur: Delft University of Technology

Other (1)

A yeast with muscle doesn’t run faster: full humanization of the glycolytic pathway in Saccharomyces cerevisiae.

Auteurs: Francine J. Boonekamp, Ewout Knibbe, Marcel Vieira-Lara, Melanie Wijsman, Marijke Luttik, Karin van Eunen, Maxime den Ridder, Renier Bron, Anna Almonacid Suarez, Pieter van Rijn, J Wolters, Martin Pabst, Jean-Marc Daran, Barbara Bakker, Pascale Daran-Lapujade
Publié dans: BioRxiv, 2021
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2021.09.28.462164