Identification and analysis of novel mitochondrial proteins encoded by small open reading frames

Informations projet

MITOsmORFs

N° de convention de subvention: 648235

DOI

10.3030/648235

Projet clôturé

Date de signature de la CE 28 Avril 2015

Date de début 1 Septembre 2015

Date de fin 31 Août 2021

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 000 000,00

Contribution de l’UE

€ 2 000 000,00

Coordonné par

UNIVERSITAETSKLINIKUM FREIBURG
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (22)

Quantitative high-confidence human mitochondrial proteome and its dynamics in cellular context

Auteurs: Marcel Morgenstern, Christian D. Peikert, Philipp Lübbert, Ida Suppanz, Cinzia Klemm, Oliver Alka, Conny Steiert, Nataliia Naumenko, Alexander Schendzielorz, Laura Melchionda, Wignand W.D. Mühlhäuser, Bettina Knapp, Jakob D. Busch, Sebastian B. Stiller, Stefan Dannenmaier, Caroline Lindau, Mariya Licheva, Christopher Eickhorst, Riccardo Galbusera, Ralf M. Zerbes, Michael T. Ryan, Claudine Kraft
Publié dans: Cell Metabolism, 2021, ISSN 1550-4131
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cmet.2021.11.001

Definition of a High-Confidence Mitochondrial Proteome at Quantitative Scale

Auteurs: Marcel Morgenstern, Sebastian B. Stiller, Philipp Lübbert, Christian D. Peikert, Stefan Dannenmaier, Friedel Drepper, Uri Weill, Philipp Höß, Reinhild Feuerstein, Michael Gebert, Maria Bohnert, Martin van der Laan, Maya Schuldiner, Conny Schütze, Silke Oeljeklaus, Nikolaus Pfanner, Nils Wiedemann, Bettina Warscheid
Publié dans: Cell Reports, Numéro 19/13, 2017, Page(s) 2836-2852, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2017.06.014

Charting organellar importomes by quantitative mass spectrometry

Auteurs: Christian D. Peikert, Jan Mani, Marcel Morgenstern, Sandro Käser, Bettina Knapp, Christoph Wenger, Anke Harsman, Silke Oeljeklaus, André Schneider, Bettina Warscheid
Publié dans: Nature Communications, Numéro 8, 2017, Page(s) 15272, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms15272

Metabolic profiling of isolated mitochondria and cytoplasm reveals compartment-specific metabolic responses

Auteurs: Daqiang Pan, Caroline Lindau, Simon Lagies, Nils Wiedemann, Bernd Kammerer
Publié dans: Metabolomics, Numéro 14/5, 2018, ISSN 1573-3882
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s11306-018-1352-x

Membrane protein insertion through a mitochondrial β-barrel gate

Auteurs: Alexandra I. C. Höhr, Caroline Lindau, Christophe Wirth, Jian Qiu, David A. Stroud, Stephan Kutik, Bernard Guiard, Carola Hunte, Thomas Becker, Nikolaus Pfanner, Nils Wiedemann
Publié dans: Science, Numéro 359/6373, 2018, Page(s) eaah6834, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aah6834

Identification of new channels by systematic analysis of the mitochondrial outer membrane

Auteurs: Vivien Krüger, Thomas Becker, Lars Becker, Malayko Montilla-Martinez, Lars Ellenrieder, F.-Nora Vögtle, Helmut E. Meyer, Michael T. Ryan, Nils Wiedemann, Bettina Warscheid, Nikolaus Pfanner, Richard Wagner, Chris Meisinger
Publié dans: The Journal of Cell Biology, Numéro 216/11, 2017, Page(s) 3485-3495, ISSN 0021-9525
Éditeur: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.201706043

Respiratory chain supercomplexes associate with the cysteine desulfurase complex of the iron–sulfur cluster assembly machinery

Auteurs: Lena Böttinger, Christoph U. Mårtensson, Jiyao Song, Nicole Zufall, Nils Wiedemann, Thomas Becker
Publié dans: Molecular Biology of the Cell, Numéro 29/7, 2018, Page(s) 776-785, ISSN 1059-1524
Éditeur: American Society for Cell Biology
DOI: 10.1091/mbc.E17-09-0555

INA complex liaises the F1Fo-ATP synthase membrane motor modules

Auteurs: Nataliia Naumenko, Marcel Morgenstern, Robert Rucktäschel, Bettina Warscheid, Peter Rehling
Publié dans: Nature Communications, Numéro 8/1, 2017, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-017-01437-z

tRNAs and proteins use the same import channel for translocation across the mitochondrial outer membrane of trypanosomes

Auteurs: Moritz Niemann, Anke Harsman, Jan Mani, Christian D. Peikert, Silke Oeljeklaus, Bettina Warscheid, Richard Wagner, André Schneider
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 114/37, 2017, Page(s) E7679-E7687, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1711430114

Quantitative proteomics identifies redox switches for global translation modulation by mitochondrially produced reactive oxygen species

Auteurs: Ulrike Topf, Ida Suppanz, Lukasz Samluk, Lidia Wrobel, Alexander Böser, Paulina Sakowska, Bettina Knapp, Martyna K. Pietrzyk, Agnieszka Chacinska, Bettina Warscheid
Publié dans: Nature Communications, Numéro 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-017-02694-8

The mitochondrial TMEM177 associates with COX20 during COX2 biogenesis

Auteurs: Isotta Lorenzi, Silke Oeljeklaus, Abhishek Aich, Christin Ronsör, Sylvie Callegari, Jan Dudek, Bettina Warscheid, Sven Dennerlein, Peter Rehling
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research, Numéro 1865/2, 2018, Page(s) 323-333, ISSN 0167-4889
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamcr.2017.11.010

Structural Basis of Membrane Protein Chaperoning through the Mitochondrial Intermembrane Space

Auteurs: Katharina Weinhäupl, Caroline Lindau, Audrey Hessel, Yong Wang, Conny Schütze, Tobias Jores, Laura Melchionda, Birgit Schönfisch, Hubert Kalbacher, Beate Bersch, Doron Rapaport, Martha Brennich, Kresten Lindorff-Larsen, Nils Wiedemann, Paul Schanda
Publié dans: Cell, Numéro 175/5, 2018, Page(s) 1365-1379.e25, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2018.10.039

Complete Native Stable Isotope Labeling by Amino Acids of Saccharomyces cerevisiae for Global Proteomic Analysis

Auteurs: Stefan Dannenmaier, Sebastian B. Stiller, Marcel Morgenstern, Philipp Lübbert, Silke Oeljeklaus, Nils Wiedemann, Bettina Warscheid
Publié dans: Analytical Chemistry, Numéro 90/17, 2018, Page(s) 10501-10509, ISSN 0003-2700
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.8b02557

Separating mitochondrial protein assembly and endoplasmic reticulum tethering by selective coupling of Mdm10

Auteurs: Lars Ellenrieder, Łukasz Opaliński, Lars Becker, Vivien Krüger, Oliver Mirus, Sebastian P. Straub, Katharina Ebell, Nadine Flinner, Sebastian B. Stiller, Bernard Guiard, Chris Meisinger, Nils Wiedemann, Enrico Schleiff, Richard Wagner, Nikolaus Pfanner, Thomas Becker
Publié dans: Nature Communications, Numéro 7, 2016, Page(s) 13021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms13021

Dynamic organization of the mitochondrial protein import machinery

Auteurs: Sebastian P. Straub, Sebastian B. Stiller, Nils Wiedemann, Nikolaus Pfanner
Publié dans: Biological Chemistry, Numéro 397/11, 2016, ISSN 1431-6730
Éditeur: Walter de Gruyter GmbH & Co. KG
DOI: 10.1515/hsz-2016-0145

Mitochondrial Machineries for Protein Import and Assembly

Auteurs: Nils Wiedemann, Nikolaus Pfanner
Publié dans: Annual Review of Biochemistry, Numéro 86/1, 2016, ISSN 0066-4154
Éditeur: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-biochem-060815-014352

Heat Stress-Induced Metabolic Remodeling in Saccharomyces cerevisiae

Auteurs: Daqiang Pan, Nils Wiedemann, Bernd Kammerer
Publié dans: Metabolites, Numéro 9/11, 2019, Page(s) 266, ISSN 2218-1989
Éditeur: Springer
DOI: 10.3390/metabo9110266

The mitochondrial carrier pathway transports non-canonical substrates with an odd number of transmembrane segments

Auteurs: Heike Rampelt, Iva Sucec, Beate Bersch, Patrick Horten, Inge Perschil, Jean-Claude Martinou, Martin van der Laan, Nils Wiedemann, Paul Schanda, Nikolaus Pfanner
Publié dans: BMC Biology, Numéro 18/1, 2020, ISSN 1741-7007
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-019-0733-6

Mitochondrial proteins: from biogenesis to functional networks

Auteurs: Nikolaus Pfanner, Bettina Warscheid, Nils Wiedemann
Publié dans: Nature Reviews Molecular Cell Biology, Numéro 20/5, 2019, Page(s) 267-284, ISSN 1471-0072
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-018-0092-0

The mitochondrial transporter SLC25A25 links ciliary TRPP2 signaling and cellular metabolism

Auteurs: Alexis Hofherr, Claudia Seger, Fiona Fitzpatrick, Tilman Busch, Elisabeth Michel, Jingting Luan, Lea Osterried, Frieder Linden, Albrecht Kramer-Zucker, Barbara Wakimoto, Conny Schütze, Nils Wiedemann, Anna Artati, Jerzy Adamski, Gerd Walz, Edmund R. S. Kunji, Craig Montell, Terry Watnick, Michael Köttgen
Publié dans: PLOS Biology, Numéro 16/8, 2018, Page(s) e2005651, ISSN 1545-7885
Éditeur: PLOS
DOI: 10.1371/journal.pbio.2005651

Mitochondrial OXA Translocase Plays a Major Role in Biogenesis of Inner-Membrane Proteins

Auteurs: Sebastian B. Stiller, Jan Höpker, Silke Oeljeklaus, Conny Schütze, Sandra G. Schrempp, Jens Vent-Schmidt, Susanne E. Horvath, Ann E. Frazier, Natalia Gebert, Martin van der Laan, Maria Bohnert, Bettina Warscheid, Nikolaus Pfanner, Nils Wiedemann
Publié dans: Cell Metabolism, Numéro 23/5, 2016, Page(s) 901-908, ISSN 1550-4131
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cmet.2016.04.005

One library to make them all: streamlining the creation of yeast libraries via a SWAp-Tag strategy

Auteurs: Ido Yofe, Uri Weill, Matthias Meurer, Silvia Chuartzman, Einat Zalckvar, Omer Goldman, Shifra Ben-Dor, Conny Schütze, Nils Wiedemann, Michael Knop, Anton Khmelinskii, Maya Schuldiner
Publié dans: Nature Methods, Numéro 13/4, 2016, Page(s) 371-378, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.3795