Are HPV vaccines ‘evolution-proof’? Multilevel evolutionary ecology of human oncoviruses

Informations projet

EVOLPROOF

N° de convention de subvention: 648963

DOI

10.3030/648963

Projet clôturé

Date de signature de la CE 30 Juillet 2015

Date de début 1 Septembre 2015

Date de fin 28 Février 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 987 492,96

Contribution de l’UE

€ 1 987 492,96

Coordonné par

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Publications

Peer reviewed articles (16)

Treating symptomatic infections and the co-evolution of virulence and drug resistance

Auteurs: Samuel Alizon
Publié dans: Peer Community Journal, Numéro 1, 2021, Page(s) e47, ISSN 2804-3871
Éditeur: Centre Mersenne
DOI: 10.24072/pcjournal.38

Reconstructing contact network structure and cross-immunity patterns from multiple infection histories

Auteurs: Christian Selinger, Samuel Alizon
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 17/9, 2021, Page(s) e1009375, ISSN 1553-7358
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1009375

Does exposure to different menstrual products affect the vaginal environment?

Auteurs: Nicolas Tessandier; Ilkay Başak Uysal; Baptiste Elie; Christian Selinger; Claire Bernat; Vanina Boué; Sophie Grasset; Soraya Groc; Massilva Rahmoun; Bastien Reyné; Noemi Bender; Marine Bonneau; Christelle Graf; Vincent Tribout; Vincent Foulongne; Jacques Ravel; Tim Waterboer; Christophe Hirtz; Ignacio G. Bravo; Jacques Reynes; Michel Segondy; Carmen Lia Murall; Nathalie Boulle; Tsukushi Kamiya;
Publié dans: Molecular Ecology, Numéro 32(10), 2023, Page(s) 2592-2601, ISSN 1365-294X
Éditeur: Wiley-Blackwell
DOI: 10.1111/mec.16678

Concomitant and productive genital infections by HSV-2 and HPV in two young women: A case report

Auteurs: Ilkay Başak Uysal; Vanina Boué; Carmen Lia Murall; Christelle Graf; Christian Selinger; Christophe Hirtz; Claire Bernat; Jacques Ravel; Jacques Reynes; Marine Bonneau; Massilva Rahmoun; Michel Segondy; Nathalie Boulle; Sophie Grasset; Soraya Groc; Tim Waterboer; Vincent Tribout; Ignacio G. Bravo; Sonia Burrel; Vincent Foulongne; Samuel Alizon; Nicolas Tessandier
Publié dans: IDCases, Numéro 30, 2023, Page(s) e01604, ISSN 2214-2509
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.31219/osf.io/u349m

Factors shaping vaginal microbiota long-term community dynamics in young adult women

Auteurs: Tsukushi Kamiya, Nicolas Tessandier, Baptiste Elie, Claire Bernat, Vanina Boué, Sophie Grasset, Soraya Groc, Massilva Rahmoun, Christian Selinger, Michael S. Humphrys, Marine Bonneau, Christelle Graf, Vincent Foulongne, Jacques Reynes, Vincent Tribout, Michel Segondy, Nathalie Boulle, Jacques Ravel, Carmen Lía Murall and Samuel Alizon
Publié dans: Peer Community Journal, Numéro 5, 2025, Page(s) e30, ISSN 2804-3871
Éditeur: Centre Mersenne
DOI: 10.24072/pcjournal.527

HPV cervical infections and serological status in vaccinated and unvaccinated women

Auteurs: Carmen Lía Murall, Bastien Reyné, Christian Selinger, Claire Bernat, Vanina Boué, Sophie Grasset, Soraya Groc, Massilva Rahmoun, Noemi Bender, Marine Bonneau, Vincent Foulongne, Christelle Graf, Eric Picot, Marie-Christine Picot, Vincent Tribout, Tim Waterboer, Ignacio G Bravo, Jacques Reynes, Michel Segondy, Nathalie Boulle, Samuel Alizon
Publié dans: Vaccine, Numéro 38/51, 2020, Page(s) 8167-8174, ISSN 0264-410X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.vaccine.2020.10.078

Cytokine response following perturbation of the cervicovaginal milieu during HPV genital infection

Auteurs: Christian Selinger, Massilva Rahmoun, Carmen Lia Murall, Claire Bernat, Vanina Boué, Marine Bonneau, Christelle Graf, Sophie Grasset, Soraya Groc, Jacques Reynes, Christophe Hirtz, Nathalie Jacobs, Samuel Alizon
Publié dans: Immunologic Research, Numéro 69/3, 2021, Page(s) 255-263, ISSN 0257-277X
Éditeur: Humana Press, Inc.
DOI: 10.1007/s12026-021-09196-2

Reconciling Pasteur and Darwin to control infectious diseases

Auteurs: Samuel Alizon, Pierre-Olivier Méthot
Publié dans: PLOS Biology, Numéro 16/1, 2018, Page(s) e2003815, ISSN 1545-7885
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.2003815

Why Human Papillomavirus Acute Infections Matter

Auteurs: Samuel Alizon, Carmen Murall, Ignacio Bravo
Publié dans: Viruses, Numéro 9/12, 2017, Page(s) 293, ISSN 1999-4915
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/v9100293

Coevolution of virulence and immunosuppression in multiple infections

Auteurs: Tsukushi Kamiya, Nicole Mideo, Samuel Alizon
Publié dans: Journal of Evolutionary Biology, Numéro 31/7, 2018, Page(s) 995-1005, ISSN 1010-061X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jeb.13280

Epithelial stratification shapes infection dynamics

Auteurs: Carmen Lía Murall, Robert Jackson, Ingeborg Zehbe, Nathalie Boulle, Michel Segondy, Samuel Alizon
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 15/1, 2019, Page(s) e1006646, ISSN 1553-7358
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006646

Modelling the evolution of viral oncogenesis

Auteurs: Carmen Lía Murall, Samuel Alizon
Publié dans: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Numéro 374/1773, 2019, Page(s) 20180302, ISSN 0962-8436
Éditeur: Royal Society of London
DOI: 10.1098/rstb.2018.0302

Natural history, dynamics, and ecology of human papillomaviruses in genital infections of young women: protocol of the PAPCLEAR cohort study

Auteurs: Carmen Lía Murall, Massilva Rahmoun, Christian Selinger, Monique Baldellou, Claire Bernat, Marine Bonneau, Vanina Boué, Mathilde Buisson, Guillaume Christophe, Giuseppe D’Auria, Florence De Taroni, Vincent Foulongne, Rémy Froissart, Christelle Graf, Sophie Grasset, Soraya Groc, Christophe Hirtz, Audrey Jaussent, Julie Lajoie, Frédérique Lorcy, Eric Picot, Marie-Christine Picot, Jacques Rave
Publié dans: BMJ Open, Numéro 9/6, 2019, Page(s) e025129, ISSN 2044-6055
Éditeur: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/bmjopen-2018-025129

Detecting within-host interactions from genotype combination prevalence data

Auteurs: Samuel Alizon, Carmen Lía Murall, Emma Saulnier, Mircea T. Sofonea
Publié dans: Epidemics, Numéro 29, 2019, Page(s) 100349, ISSN 1755-4365
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.epidem.2019.100349

Episome partitioning and symmetric cell divisions: Quantifying the role of random events in the persistence of HPV infections

Auteurs: Thomas Beneteau, Christian Selinger, Mircea T. Sofonea, Samuel Alizon
Publié dans: PLOS Computational Biology, Numéro 17/9, 2021, Page(s) e1009352, ISSN 1553-7358
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1009352

Viral and immune dynamics of genital human papillomavirus infections in young women with high temporal resolution

Auteurs: Nicolas Tessandier, Baptiste Elie, Vanina Boué, Christian Selinger, Massilva Rahmoun, Claire Bernat, Sophie Grasset, Soraya Groc, Anne-Sophie Bedin, Thomas Beneteau, Marine Bonneau, Christelle Graf, Nathalie Jacobs, Tsukushi Kamiya, Marion Kerioui, Julie Lajoie, Imène Melki, Jean-Luc Prétet, Bastien Reyné, Géraldine Schlecht-Louf, Mircea T. Sofonea, Olivier Supplisson, Chris Wymant, Vincent F
Publié dans: PLOS Biology, Numéro 23, 2025, Page(s) e3002949, ISSN 1545-7885
Éditeur: PLoS
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002949

Book chapters (1)

Invasions of Host-Associated Microbiome Networks

Auteurs: C.L. Murall, J.L. Abbate, M. Puelma Touzel, E. Allen-Vercoe, S. Alizon, R. Froissart, K. McCann
Publié dans: Advances in Ecological Modeling, Numéro 57, 2017, Page(s) 201-281
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.aecr.2016.11.002