Objetivo
Single-molecule enzymology offers new possibilities to dissect catalytic reactions that were previously unapproachable using biochemistry techniques conducted in the bulk. In particular, recent discoveries conducted at the single molecule level, such as the unanticipated force-mediated protein degradation pathway in the proteasome, highlight the close relation between mechanical forces and proteolysis in vivo. While much has been discovered about protein enzymology in the recent decades, the question of how mechanical force affects enzymatic catalysis remains vastly elusive. The main goal of this proposal is to understand the mechanobiology of proteolysis at the single molecule level. We will use the newly developed force-clamp spectroscopy technique, together with molecular biology engineering techniques and bioinformatics structural analysis to elucidate the molecular mechanisms that underlie protease catalysis under mechanical force. Successful enzymatic activity relies on the enzyme:substrate (E:S) assembly. Upon mechanical unfolding, proteins unveil their buried substrate sites, also called cryptic sites, thus favoring the formation of the E:S complex and ultimately permitting the subsequent chemical reaction. A key feature of recent mechano-chemistry experiments at the single bond level is that the rate at which the reduction of a protein disulfide bond occurs in the presence of a nucleophile is exponentially dependent on the stretching force. Hence, it is tempting to speculate that, in the case of an enzymatic reaction, the catalytic rate will be also force-dependent. We anticipate that the curved geometry of the bound substrate inhibits the E:S assembly at high-forces, implying a novel mechano-specificity character of proteases. Within a multidisciplinary approach, here we propose a series of innovative experiments to directly probe the effect of force on the kinetics of protease hydrolysis.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
- ciencias naturales ciencias físicas mecánica clásica mecánica estadística
- ciencias naturales ciencias químicas catálisis
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas enzima
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2014
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
WC2R 2LS London
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.