Objetivo
Protein-protein tridimensional (3D) structures are fundamental for structural biology and drug discovery. Many docking algorithms were developed for that purpose, but they have limited accuracy in generating native-like structures and identifying the most correct one, particularly in the case of membrane proteins such as G-protein Coupled Receptors (GPCRs). In order to deal with these complex systems and overcome the limitations of existing software, we will develop and optimize computational approaches and construct novel combinations of mature methodologies, to serve in the study of membrane proteins in general. In particularly, we will focus in: i) improving the search and scoring algorithms for the docking process of membrane proteins, ii) developing software to accurately predict the high-order oligomers interfacial residues, and iii) constructing a docking algorithm able to predict their 3D oligomeric structure. Our new approaches will be applied to a relevant biological system: the dopamine receptor type 2 (D2R), a typical member of Class A GPCRs involved in many cognitive, emotional and motor functions. D2R acts by ligand-dependent signalling through two major systems: the G-proteins, and the Arrestin proteins (Arr-s). How ligands determine the preference for one or the other is not yet understood at the molecular level, and this precludes both the characterization of pathway selectivity and the design of biased ligands. More importantly, the physiological relevance of oligomerization for this process is still topic of vigorous debate. Therefore, building on both my unique expertise and Prof. Bonvin well-known impact in methodological development, this project will yield novel methods and approaches to serve in the study of membrane protein systems and their functional mechanisms, benefiting the entire research field. It will also provide truly new fundamental knowledge and insights into the selectivity of D2R signalling.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información software
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias médicas y de la salud medicina básica química medicinal
- ciencias naturales informática y ciencias de la información inteligencia artificial aprendizaje automático
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular biología estructural
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2014
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
3584 CS Utrecht
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.