Objectif
Protein-protein tridimensional (3D) structures are fundamental for structural biology and drug discovery. Many docking algorithms were developed for that purpose, but they have limited accuracy in generating native-like structures and identifying the most correct one, particularly in the case of membrane proteins such as G-protein Coupled Receptors (GPCRs). In order to deal with these complex systems and overcome the limitations of existing software, we will develop and optimize computational approaches and construct novel combinations of mature methodologies, to serve in the study of membrane proteins in general. In particularly, we will focus in: i) improving the search and scoring algorithms for the docking process of membrane proteins, ii) developing software to accurately predict the high-order oligomers interfacial residues, and iii) constructing a docking algorithm able to predict their 3D oligomeric structure. Our new approaches will be applied to a relevant biological system: the dopamine receptor type 2 (D2R), a typical member of Class A GPCRs involved in many cognitive, emotional and motor functions. D2R acts by ligand-dependent signalling through two major systems: the G-proteins, and the Arrestin proteins (Arr-s). How ligands determine the preference for one or the other is not yet understood at the molecular level, and this precludes both the characterization of pathway selectivity and the design of biased ligands. More importantly, the physiological relevance of oligomerization for this process is still topic of vigorous debate. Therefore, building on both my unique expertise and Prof. Bonvin well-known impact in methodological development, this project will yield novel methods and approaches to serve in the study of membrane protein systems and their functional mechanisms, benefiting the entire research field. It will also provide truly new fundamental knowledge and insights into the selectivity of D2R signalling.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information logiciel
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale chimie médicinale
- sciences naturelles informatique et science de l'information intelligence artificielle apprentissage automatique
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire biologie structurale
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2014
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
3584 CS Utrecht
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.