PROTEASES VISUALIZATION DURING TUMOR PROGRESSION

Informations projet

PROVIST

N° de convention de subvention: 661187

DOI 10.3030/661187

Projet clôturé

Date de signature de la CE 24 Avril 2015

Date de début 1 Janvier 2016

Date de fin 31 Decembre 2018

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total € 227 361,60

Contribution de l’UE € 227 361,60

Coordonné par

POLITECHNIKA WROCLAWSKA
Poland

Publications

Peer reviewed articles (11)

Counter Selection Substrate Library Strategy for Developing Specific Protease Substrates and Probes

Auteurs: Marcin Poreba, Rigmor Solberg, Wioletta Rut, Ngoc Nguyen Lunde, Paulina Kasperkiewicz, Scott J. Snipas, Marko Mihelic, Dusan Turk, Boris Turk, Guy S. Salvesen, Marcin Drag
Publié dans: Cell Chemical Biology, Numéro 23/8, 2016, Page(s) 1023-1035, ISSN 2451-9456
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chembiol.2016.05.020

Synthesis of a HyCoSuL peptide substrate library to dissect protease substrate specificity

Auteurs: Marcin Poreba, Guy S Salvesen, Marcin Drag
Publié dans: Nature Protocols, Numéro 12/10, 2017, Page(s) 2189-2214, ISSN 1754-2189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nprot.2017.091

Highly sensitive and adaptable fluorescence-quenched pair discloses the substrate specificity profiles in diverse protease families

Auteurs: Marcin Poreba, Aleksandra Szalek, Wioletta Rut, Paulina Kasperkiewicz, Izabela Rutkowska-Wlodarczyk, Scott J. Snipas, Yoshifumi Itoh, Dusan Turk, Boris Turk, Christopher M. Overall, Leszek Kaczmarek, Guy S. Salvesen, Marcin Drag
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 7, 2017, Page(s) 43135, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/srep43135

Selective imaging of cathepsin L in breast cancer by fluorescent activity-based probes

Auteurs: Marcin Poreba, Wioletta Rut, Matej Vizovisek, Katarzyna Groborz, Paulina Kasperkiewicz, Darren Finlay, Kristiina Vuori, Dusan Turk, Boris Turk, Guy S. Salvesen, Marcin Drag
Publié dans: Chemical Science, Numéro 9, 2018, Page(s) 2113-2129, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/C7SC04303A

Extensive peptide and natural protein substrate screens reveal that mouse caspase-11 has much narrower substrate specificity than caspase-1

Auteurs: Monica L Gonzalez Ramirez, Marcin Poreba, Scott J Snipas, Katarzyna Groborz, Marcin Drag, Guy S Salvesen
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, Numéro 293(18):7058-7067, 2018, Page(s) jbc.RA117.001329, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.RA117.001329

Emerging challenges in the design of selective substrates, inhibitors and activity-based probes for indistinguishable proteases

Auteurs: Paulina Kasperkiewicz, Marcin Poreba, Katarzyna Groborz, Marcin Drag
Publié dans: The FEBS Journal, Numéro 284/10, 2017, Page(s) 1518-1539, ISSN 1742-464X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/febs.14001

Caspase selective reagents for diagnosing apoptotic mechanisms

Auteurs: Marcin Poreba, Katarzyna Groborz, Mario Navarro, Scott J. Snipas, Marcin Drag, Guy S. Salvesen
Publié dans: Cell Death & Differentiation, Numéro 26/2, 2019, Page(s) 229-244, ISSN 1350-9047
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41418-018-0110-y

Exploring the prime site in caspases as a novel chemical strategy for understanding the mechanisms of cell death: a proof of concept study on necroptosis in cancer cells

Auteurs: Katarzyna Groborz, Monica L. Gonzalez Ramirez, Scott J. Snipas, Guy S. Salvesen, Marcin Drąg, Marcin Poręba
Publié dans: Cell Death & Differentiation, Numéro Epub ahead of print, 2019, ISSN 1350-9047
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41418-019-0364-z

Potent and selective caspase-2 inhibitor prevents MDM-2 cleavage in reversine-treated colon cancer cells

Auteurs: Marcin Poreba, Wioletta Rut, Katarzyna Groborz, Scott J. Snipas, Guy S. Salvesen, Marcin Drag
Publié dans: Cell Death & Differentiation, Numéro Epub ahead of print, 2019, ISSN 1350-9047
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41418-019-0329-2

Fluorescent probes towards selective cathepsin B detection and visualization in cancer cells and patient samples

Auteurs: Marcin Poreba, Katarzyna Groborz, Matej Vizovisek, Marco Maruggi, Dusan Turk, Boris Turk, Garth Powis, Marcin Drag, Guy S. Salvesen
Publié dans: Chemical Science, Numéro Just accepted, 2019, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c9sc00997c

Selective Substrates and Activity-Based Probes for Imaging of the Human Constitutive 20S Proteasome in Cells and Blood Samples

Auteurs: Wioletta Rut, Marcin Poręba, Paulina Kasperkiewicz, Scott J. Snipas, Marcin Drąg
Publié dans: Journal of Medicinal Chemistry, Numéro 61/12, 2017, Page(s) 5222-5234, ISSN 0022-2623
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.8b00026

Non-peer reviewed articles (1)

The Activome: multiplexed probing of activity of proteolytic enzymes using mass cytometry-compatible activity-based probes (TOF-probes)

Auteurs: Marcin Poreba, Katarzyna Groborz, Wioletta Rut, Milind Pore, Scott J. Snipas, Matej Vizovisek, Boris Turk, Peter Kuhn, Marcin Drag, Guy S. Salvesen
Publié dans: bioRxiv, 2019, ISSN 1350-9047
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/775627